| 添加分子标签的RNA-Seq分析试剂盒上市啦！ | ||||||||||||||||
| 有时候，标签是个贬义词，害怕被贴标签，害怕被定义，被束缚。 但有时候，标签又是个褒义词。比如在构建测序文库时，通过添加特别的“分子标签”（Unique Molecular Identifiers, UMIs），可以更好的校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取。 |
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| （您也可以抽大约五分钟时间，读一读我们之前推送UDI?UMI?快来围观宝藏主播找答案吧的文章，相信可以帮您详尽地了解UMI和UDI。） | ||||||||||||||||
| 目前，各路科研工作人员面临的NGS检测灵敏度与特异性的瓶颈，可能是由样品准备、扩增偏差及测序错误所引起的。而向Ilumina文库添加特有的分子标签UMI能有效改善这一问题。出于文库制备与测序质量直接相关的考虑，Takara特别优化推出了接头上带UMIs及整合UDIs的全新产品SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian！ | ||||||||||||||||
| 它的前一代产品SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian仰仗自身过硬的产品性能，在肿瘤研究、病原微生物检测、液体活检等领域的转录组分析大受好评。 |
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| 那么，SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian有何过人之处？ | ||||||||||||||||
| ■ 来自UMIs的“鼎力相助” |
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| 非常重要的一点，添加分子标签（UMIs）：在文库制备过程中，通过逆转录步骤（在PCR扩增之前）添加8nt UMI，可以灵敏地识别PCR重复片段并校正PCR扩增错误，从而进行正确的样本数据回溯，提供更可靠的RNA-Seq分析！ | ||||||||||||||||
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| ■ UDIs技术的“加持” |
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| 该试剂盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit - 24U (Code No. 634451)，能更正确拆析采用图案化流动槽技术（Patterned flow cell）测序平台（如NovaSeq™ system）的下机数据，同时也支持更多样本同时测序。 | ||||||||||||||||
| ■ 直击痛点，无需担心RNA质量差 |
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| 与前一代一样，它同样无惧RNA降解，能分析质量较差的FFPE、cfRNA、外泌体以及病原微生物来源的样本。并且无需核糖体RNA前处理，更小的手动操作误差，可直接以人、大/小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或者10-1000个细胞样本起始，快速高效的构建链特异性文库，科研人员再不用担心珍贵样本损失了！ | ||||||||||||||||
| ■ Takara案例分析 |
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| 从FFPE样本中分离纯化核酸进行NGS分析研究逐渐成为重要手段，但由于FFPE样本容易发生核酸的降解和损伤，所以从有限且珍贵的FFPE样本中获得完整且正确的信息进行建库测序非常具有挑战性！但有了Takara FFPE样本分析利器，事情正在发生变化！ | ||||||||||||||||
| Takara科学家采用以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE组织提取的总RNA起始，采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian制备RNA-Seq文库（均做两个重复），并使用NextSeq 500进行测序。 | ||||||||||||||||
| 结果显示，同一样品不同起始量的情况下，测序数据非常相似，并且技术重复之间具有高度一致性。而TPM≥1的基因检测数也均超过18,000。特别值得注意的是，比对到核糖体rRNA和线粒体基因组的比率相对较低。 | ||||||||||||||||
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| 所以对有限且珍贵的样本的测序分析具有较大难度时，选它--SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian，没错！ | ||||||||||||||||
| ■ 产品列表 |
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| 从FFPE样本中分离纯化核酸进行NGS分析研究逐渐成为重要手段，但由于FFPE样本容易发生核酸的降解和损伤，所以从有限且珍贵的FFPE样本中获得完整且正确的信息进行建库测序非常具有挑战性！但有了Takara FFPE样本分析利器，事情正在发生变化！ | ||||||||||||||||
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页面更新：2020-12-02 14:18:55
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