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| 空间转录组学分析试剂盒 |
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| ■ 产品亮点 |
√ 可以对冷冻组织开展全转录组空间分析本
√ 接近单细胞级别的分辨率，可解析所有基因
√ 利用带有DNA条形码的微珠（Beads）捕获mRNA
√ 不需要NGS以外的专用设备和探针
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| ■ 制品说明 |
| Curio Seeker Spatial Transcriptomics Kit将带有DNA条形码的单层10 μm微珠（Beads）平铺在玻片（Tile）上。通过在玻片上放置组织切片来捕获RNA。由于DNA条形码具有表示位置信息的固定序列，因此通过收集微珠并进行NGS分析，可以进行高分辨率的全转录组分析和空间分析。由于以含有polyA的全转录组为对象进行NGS分析，因此也支持人、鼠以外的真核生物。 |
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| ■ 实验流程 |
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| 将组织切片放置在Curio Seeker玻片（Tile）上，与带有DNA条形码的微珠结合捕获mRNA，然后进行反转录。之后微珠从玻片上解离，进行第二链合成以及cDNA扩增。纯化的cDNA进行文库制备并测序。生成的FASTQ文件通过Curio Seeker生物信息学软件处理，获得组织切片的完整全转录组的空间图谱。 |
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| ■ 产品规格：3 mm x 3 mm 和10 mm x 10 mm |
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Curio Seeker 3x3 kit |
Curio Seeker 10x10 kit |
| 用途 |
全转录组空间分析
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| 分辨率 |
10 μm
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| 样本类型 |
新鲜冷冻组织（Fresh frozen）
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| index primer |
Seeker Dual Indexing Primer Kit v2
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| 分析软件 |
Curio Seeker bioinformatics pipeline
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| 玻片(tile)大小 |
3 mm × 3 mm
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10 mm × 10 mm
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| 所需时间/手动操作时间 |
8 h／2.5 h
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8.5 h／3 h
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| 推荐测序深度* |
～400 M
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～2 B
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| * 推荐测序深度取决于组织类型 |
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京公网安备 110114000405号