SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell | |||||||
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图1. SMART-Seq mRNA Single Cell & SMART-Seq mRNA Single Cell LP的cDNA合成流程 | |||||||
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图2. SMART-Seq mRNA Single Cell LP的文库制备工作流程 | |||||||
■ 数据展示: | |||||||
注:以下展示来源于SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和 SMART-Seq Single Cell PLUS (SSsc PLUS)的数据。因为两者分别是SMART-Seq mRNA Single Cell 和SMART-Seq mRNA Single Cell LP等效替换品。 | |||||||
● 灵敏度更高的单细胞全长转录组分析 | |||||||
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图3. 与Smart-seq2法的比较 | |||||||
Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法(Smart-seq2,20个重复)合成cDNA(均进行19个PCR循环扩增),所有样本都均一化至1.75M paired-end reads,然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。 Panel A 根据cDNA的制备方法不同,结果也不同。相比而言,Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高,而检测到基因鉴别的reads数相对较少。 Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。 |
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● SMART-Seq mRNA Single Cell LP提供完整的单细胞RNA-Seq建库体验! | |||||||
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图4. 与其他同类产品比较数据 | |||||||
Panel A. 以10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。 Panel B. 从测试数据中可以看出,SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍,而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪,如Novaseq。 Panel C. 两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序,并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库,SSsc PLUS文库能检出更多的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息! |
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页面更新:2024-08-21 15:54:55