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单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634786 SMART-Seq mRNA Single Cell LP 24 Rxns ¥18,634
Clontech 634787 SMART-Seq mRNA Single Cell LP 96 Rxns ¥63,356
Clontech 634788 SMART-Seq mRNA Single Cell LP 4×96 Rxns ¥228,082
Clontech 634789 SMART-Seq mRNA Single Cell 24 Rxns ¥15,791
Clontech 634790 SMART-Seq mRNA Single Cell 96 Rxns ¥53,691
Clontech 634785 SMART-Seq mRNA Single Cell 4×96 Rxns ¥193,290
无标题文档
SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
◆ 操作简便,基于Plate的工作流程 - 可直接以FACS或其他方法分选的单细胞起始
◆ 单管操作流程 - SMART-Seq mRNA Single Cell LP包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差
◆ 灵敏度高且一致性好 - 非常适用于单细胞(尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核)RNA-Seq的研究,可检测更多基因
◆ 可靠的全长cDNA分析 - 性能优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如Smart-seq2
◆ 测序性能 - SMART-Seq mRNA Single Cell LP搭配Unique Dual Index kits(单独购买),即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪(如Novaseq)分析,也能得到正确结果
◆ 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型Illumina测序仪分析(如Novaseq),或保存剩余的文库用于多次测序
◆ 高度灵活的工作流程 - 可与自动化设备兼容
    ◇ SPT Labtech mosquito HV user guide
    ◇ Formulatrix MANTIS Microfluidic Liquid Handler user guides
        · Full-volume
        · Quarter-volume

 

■ 产品说明:
SMART-Seq mRNA Single Cell Kit (SSmRNA Single Cell) 和SMART-Seq mRNA Single Cell LP Kit (SSmRNA Single Cell LP) 是两款具有高灵敏度和高可再现性、适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析试剂盒。试剂盒采用oligo(dT)引物,可从一些RNA含量非常低的单细胞(如PBMC、T细胞、B细胞)直接起始,合成高品质的全长cDNA。使用SSmRNA Single Cell LP kit搭配 Unique Dual Index kits (单独购买),最多可以制备384 Illumina测序文库。SSmRNA Single Cell LP kit提供完整的单细胞RNA-Seq分析流程,包含从样本制备cDNA、文库构建以及搭配使用的生物信息学分析软件进行数据分析的流程。
SSmRNA Single Cell是基于SMART技术(Switching Mechanism at 5′ End of RNA Template),提供全长转录本信息,支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等,具有更高的再现性和均一的gene body覆盖度,而且高GC含量转录本也能得到正确的分析。同时,Takara科学家对这一技术进行优化改良,使得这个试剂盒更适合单细胞分析,能得到更多有效reads、更高的基因检测数,对珍贵样本的分析更加深入!
SSmRNA Single Cell LP在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823)及单次使用的双端特殊index(UDI),提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶,以实现对合成cDNA的片段化,利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段,单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库!
如果是以高品质的少量细胞(<1,000)或者微量Total RNA起始时,推荐使用SMART-Seq mRNA LP KitSMART-Seq mRNA LP (with UMIs) Kit
如果是以随机引物起始,对少量细胞或者降解的Total RNA样本进行RNA-Seq分析时,推荐使用SMART-Seq Stranded Kit
 
■ 实验流程概要:
图1. SMART-Seq mRNA Single Cell & SMART-Seq mRNA Single Cell LP的cDNA合成流程
 
图2. SMART-Seq mRNA Single Cell LP的文库制备工作流程
 
■ 数据展示:
注:以下展示来源于SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和 SMART-Seq Single Cell PLUS (SSsc PLUS)的数据。因为两者分别是SMART-Seq mRNA Single Cell 和SMART-Seq mRNA Single Cell LP等效替换品。
 
灵敏度更高的单细胞全长转录组分析
图3. 与Smart-seq2法的比较
 
Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法(Smart-seq2,20个重复)合成cDNA(均进行19个PCR循环扩增),所有样本都均一化至1.75M paired-end reads,然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。
Panel A 根据cDNA的制备方法不同,结果也不同。相比而言,Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高,而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。
 
SMART-Seq mRNA Single Cell LP提供完整的单细胞RNA-Seq建库体验!
图4. 与其他同类产品比较数据
 
Panel A. 以10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。
Panel B. 从测试数据中可以看出,SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍,而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪,如Novaseq。
Panel C. 两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序,并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库,SSsc PLUS文库能检出更多的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息!
 
 
产品详情请点击:
 
 

页面更新:2024-02-01 08:20:25

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