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技术服务信息

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SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR Mammalian)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634360 SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR Mammalian) 24 Rxns ¥17,941
Clontech 634361 SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR Mammalian) 96 Rxns ¥49,373
Clontech 634362 SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR Mammalian) 4 × 96 Rxns ¥177,972
Clontech 634756 Unique Dual Index Kit (1–24) 24 Rxns ¥2,737
Clontech 634752 Unique Dual Index Kit (1–96) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634753 Unique Dual Index Kit (97–192) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634754 Unique Dual Index Kit (193–288) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634755 Unique Dual Index Kit (289–384) 96 Rxns ¥7,370
单细胞/微量样本链特异性RNA-Seq分析
SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR Mammalian)
· 高灵敏度:仅需7 h即可完成测序文库的制备
· 兼容性广:支持1-1,000个完整的哺乳动物细胞或10 pg-10 ng(降解或者高质量)total RNA起始
· 再现性高:可以对单细胞或者total RNA,准确检测包含编码和非编码RNA在内的全部转录组
· 准确性高:保留链特异性,获得全长总RNA序列信息
 
注:SMART-Seq Total RNA-Seq Single Cell (ZapR Mammalian) 是SMART-Seq Stranded Kit的替代品,性能提升,如下所示:
 
i:提升ZapR技术去除rRNA cDNA效率,以更好地剔除不需要的reads信息
ii:试剂盒中不包含index,但可以与Unique Dual Index (UDI) kits(24Rxns,96Rxns)灵活地搭配使用
 
■ 产品说明
SMART-Seq Total RNA-Seq Single Cell (ZapR Mammalian)采用随机引物法,可以在单细胞水平分析包括编码和非编码RNA在内的全部转录组。本试剂盒包含用于生成链特异性文库的试剂,包括cDNA合成和扩增模块,以及ZapR rRNA去除模块。
本试剂盒采用 SMART 技术(Switching Mechanism at the 5' end of RNA Template) ,包括对链特异性RNA-Seq的SMART方法进行改良,简化了文库制备流程并提升了测序性能。此外,与SMART-Seq mRNA和SMART-Seq mRNA HT不同,使用随机引物而不是oligo (dT) 引物起始反转录反应,因此捕获的是全部转录组而不仅仅是编码RNA部分。
SMART-Seq Total RNA-Seq Single Cell (ZapR Mammalian) 专门设计用于从单个细胞起始提供灵敏度高和重复性好的数据,同时操作流程短。本试剂不需要额外的rRNA去除方法或者试剂盒,并且生成的是保留链来源的测序文库。
如果是以oligo-dT引物起始对单细胞或者微量高品质的RNA进行cDNA合成时,推荐使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs), SMART-Seq mRNA LP,或SMART-Seq mRNA HT LP
 
不同样品起始量解决方案
·10-100 ng总RNA,推荐使用SMART-Seq Total RNA Mid Input
·100 ng-1 μg总RNA,推荐使用SMART-Seq Total RNA High Input (RiboGone Mammalian)
 
■ 流程概要
 
■ 性能数据
不同起始量RNA样本起始,均可有效去除核糖体RNA来源cDNA
选择10 pg和10 ng的人脑RNA样本起始,使用SMART-Seq Total RNA Pico Input制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理(+)和未处理(-),并通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。最后使用CogentAP 对2x106 PE reads进行数据分析。兼容不同起始量起始样本,有效地去除rRNA来源的cDNA。
Panel A的柱状图和Panel B的表格数据展示了用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit处理(+)和未处理(-)的文库的reads分布
 
不同起始量RNA样本起始,均可获得可靠的结果
Panel A的柱状图和Panel B的表格数据分别展示了用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit处理(+)和未处理(-)的文库基因检测数和转录本检测数
 
 
产品详情请点击:
 
 

页面更新:2024-07-08 15:18:43