高通量单细胞全长转录组分析解决方案！

机构用户解决方案

产品选择指南

一般PCR相关制品

PCR Enzyme的选择 PCR原理说明 Takara优选酶多功能酶高保真酶：PrimeSTAR系列基本PCR：Taq系列 Powerful PCR：MightyAmp系列直接电泳的酶制品特殊用途：多重PCR，防污染等高端PCR酶（Clontech） DNA PCR相关制品 RNA PCR相关制品 PCR Subtraction相关制品 PCR仪器
等温扩增相关制品

等温扩增酶
定量PCR相关制品

qPCR学习中心 qPCR套装反转录反应（qPCR专用）反转录反应试剂(Clontech) 嵌合荧光法检测(Takara) 嵌合荧光法检测(Clontech) miRNA 嵌合荧光法检测探针检测 Cycleave探针检测 qPCR－仪器 qPCR Primer qPCR－RNA/DNA的制备
cDNA合成 & 克隆

克隆学习中心 DNA Ligation TA克隆和平滑末端克隆 In-Fusion无缝克隆 cDNA合成&文库构建 SMART全长cDNA合成&文库构建 Random Mutagenesis Site-Directed Mutagenesis 基因组DNA序列调取试剂盒 Vector（克隆用）感受态细胞修饰酶/Ligases 修饰酶/磷酸酶、激酶修饰酶/DNA & RNA Polymerase 修饰酶/焦磷酸酶修饰酶/RTase、RNase Inhibitor 修饰酶/核酸酶、拓扑异构酶 Nucleotide Buffer（Powder）etc. 用于mRNA生产的酶（HQ级） Others（基因工程相关制品）
NGS相关制品

NGS 学习中心单细胞 RNA-Seq 单细胞 DNA-Seq RNA-Seq DNA-Seq 生殖健康表观遗传学分析免疫库分析单细胞分选系统 NGS关联制品 PCR酶（NGS用）前代RNA-Seq/DNA-Seq制品
自动化系统

自动化学习中心高通量单细胞分选系统ICELL8 cx 及其应用高通量Real-Time PCR系统自动化NGS文库制备系统高通量单细胞分选系统ICELL8应用
核酸提取、纯化及DNA标记

DNA片段、质粒DNA纯化基因组DNA纯化试剂(柱式法) 基因组DNA纯化试剂(试剂型) RNA提取、纯化试剂(柱式法) RNA提取、纯化试剂(试剂型) RNA保存试剂 Small RNA提取试剂体液样品exosome提取试剂病毒核酸纯化试剂盒酵母核酸纯化试剂盒核酸提取及纯化制品-Others DNA标记标记DNA-蛋白质的回收
限制酶

限制酶基本信息常规限制酶系列产品 QuickCut限制酶 RNA限制酶
电泳相关制品

核酸染料 DNA Markers RNA Markers 蛋白质Markers Agarose Loading Buffer 常用缓冲液方便装电泳相关装置
蛋白质互作研究（酵母杂交系统）

Takara酵母杂交学习中心 Matchmaker^® Gold酵母双杂系统 Matchmaker^® Gold酵母单杂系统互作的确认和评价 Matchmaker相关制品
表达调节及蛋白质性能分析

iDimerize^™蛋白质互作诱导系统 ProteoTuner^™蛋白质调节系统 Tet诱导表达系统
蛋白质表达相关制品

E.coli蛋白质表达 Brevibacillus/Bacillus蛋白质表达哺乳动物细胞蛋白质表达昆虫细胞蛋白质合成(Clontech) 无细胞蛋白质合成系统 Protein Refolding
蛋白质纯化、分析和检测

Capturem新型膜技术应用蛋白质样品制备 His标签融合蛋白质纯化 GST标签融合蛋白质纯化生物素标签融合蛋白质纯化 DYKDDDDK标签融合蛋白质纯化 Myc标签融合蛋白质纯化抗体纯化蛋白质IP&Co-IP 糖/磷酸化蛋白质纯化蛋白质检测蛋白质电泳胶染色蛋白质定量蛋白酶（His标签去除）蛋白酶（氨基酸序列分析）
基因导入（Virus、Vectors）

病毒基因传递系统选择向导重组慢病毒(Lentivirus)制品重组逆转录病毒(Retrovirus)制品重组腺相关病毒(AAV)制品重组腺病毒(Adenovirus)制品哺乳动物细胞用载体酵母、丝状真菌用载体植物用载体
转染试剂

Xfect转染试剂选择向导质粒转染试剂 RNA转染试剂 Protein转染试剂
干细胞研究相关制品

干细胞学习中心干细胞基因操作 (Cell reprogramming) 细胞 (Cell) 细胞培养产品 (Cell culture) 抗体 (Antibodies) 分化试剂盒和多能性监测 (Pluripotency and Differentiation ) 基因编辑（Gene Editing）
表观遗传学相关制品

甲基化DNA富集相关制品 PCR/qPCR相关制品 Control Genome DNA 甲基化DNA相关酶制品亚硫酸氢盐处理相关制品
基因组编辑相关制品

CRISPR/Cas9 Cre重组酶基因敲入用长单链DNA制备
荧光蛋白质 & 报告系统

荧光蛋白质按颜色、名称分类荧光蛋白质按用途分类荧光蛋白质相关制品报告系统
抗体 & ELISA & 细胞信号转导

细胞增殖、细胞毒性测定细胞凋亡（Takara）细胞凋亡（Clontech） EIA试剂盒（Takara）免疫染色关联制品细胞信号转导（Clontech）酶活性测定试剂盒脂肪细胞、骨细胞分化试剂抗体（Takara）
细胞 & 培养相关制品

细胞培养相关制品细胞生物学检测试剂细胞解冻仪器
microRNA & RNAi研究相关制品

RNA合成提取及纯化制品 microRNA定量PCR miRNA表达 Small RNA克隆 shRNA表达检测合成siRNA定量 RNAi相关制品
Library & cDNA & RNA

Human cDNA libraries series Mouse cDNA libraries series Rat cDNA libraries series cDNA、Genome DNA Total RNA & Poly A⁺ RNA
糖工学相关制品

糖工学酶糖工学试剂盒 Glycosphingolipid解析试剂
应用检测（食品-环境-人）

活菌DNA检测相关制品防污染相关制品食物中毒检测（PCR）食物中毒检测 (Real Time PCR) 食物中毒检测 (按Target选择) 肉种鉴定相关制品水质检测人感染症检测菌种鉴定支原体检测
仪器相关制品

PCR仪器支持中心 Q-PCR仪 E-PCR仪电泳仪器产品
Clontech相关组分信息表

Clontech相关组分信息表

技术服务信息

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高通量单细胞全长转录组分析解决方案！

SMART-Seq Pro & ICELL8 cx平台联合分析

全长序列覆盖可以实现对整个转录组的差异表达分析，并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。经深度优化推出的SMART-Seq Pro Application Kit（Cat No. 640257），具备良好的单细胞全长mRNA分析能力，在ICELL8 cx单细胞分析平台上的一张微孔芯片内，经过一系列分注和扩增步骤后，获得无偏倚的全长cDNA，并通过Illumina Bead-Linked Transposome（BLT）完成酶切片段化，同时引入Illumina特异性测序接头，可高效完成1,200～1,500个单细胞 (核)文库构建，完整的分析方案同时整合了生物信息学工具，为“藏珠于海”的转录水平稀有生物标志物发掘提供了有力工具。

ICELL8 cx Single-Cell System纳升级高通量自动化单细胞分析平台（点击获取产品手册）

※ 端到端的解决方案：从文库制备到测序数据分析工具
※ 覆盖全长mRNA：捕获转录组中“深藏”的关键生物标志物，如基因融合、剪接异构体
※ 高通量单细胞分析：可以平行地从＞1,000个单细胞中生成测序数据
※ 样品配置灵活：一次实验最多可对八种细胞样品进行分析
※ 减少样品操作：减小数据波动，构建测序文库前ICELL8 cx平台自动鉴定并分选出您感兴趣的细胞，仅对这些细胞进行试剂分注
※ Illumina平台测序文库：制备的测序文库适用于Illumina全系平台
※ 易用的生物信息学分析工具：Cogent NGS Analysis Pipeline和Cogent NGS Discovery Software

货号	产品
640257	SMART-Seq^® Pro Application Kit - 2 Chips
640019	ICELL8^® 350v Chip（芯片）
640188	ICELL8^® cx Single-Cell System（仪器

旧版本：SMART-Seq^® ICELL8^® cx Application Kit 1 Chip（Cat No. 640222）仍可购买

√性能展示

我们比较了SMART-Seq Pro与实验室自制方法SMART-seq2（SS2）在对低RNA含量的原代细胞（如PBMC）等不同细胞样本的检测敏感性差异，发现SMART-Seq Pro试剂盒识别并检测到的基因数量明显比SS2多，突出了SS Pro具有揭示罕见生物事件的能力。

图A：基于转录本表达的人PBMC细胞簇
图B/C：选择性剪切产生的不同PTPRC亚型：PTPRC-201和PTPRC-209的不同表达水平
图D: 每个细胞簇中PTPRC同种亚型的不同表达水平

SMART-Seq Pro除了可以对基因表达谱进行分析外，还具有检测不同PTPRC亚型转录水平的能力。通过SMART-Seq Pro进行全长转录分析，可额外获得3’端分析所遗漏的生物学信息，结合Congent NGS生信分析工具，提供对单细胞样本中重要生物标志物的高灵敏检测方案。

数据来源于Takara Bio USA, Inc.

自动化ICELL8 cx系统结合SMART Seq-Pro可以识别X公司系统上丢失的亚型表达数据。
SMART Seq-Pro能够识别跨外显子3、4、5、6和7的Junction reads，并揭示了PTPRC-201和PTPRC-209同种型的不同特征。而X公司末端计数法产生的数据则无法识别这些外显子区域中的junctions reads（峰值代表来自未对准读数的噪声）。

详情内容
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√应用案例速享

文献题目：Single cell full-length transcriptome of human subcutaneous adipose tissue reveals unique and heterogeneous cell populations

发表期刊：iScience

发表时间：2022年8月19日

发表机构： AdventHealth translational research institute, Icahn School of Medicine

方案设计：
对两名受测女性进行了皮下腹部脂肪组织活检（STAR方法）取样。每个活检样本的一部分快速冷冻，用于snRNA-Seq的细胞核提取。另一部分用胶原酶缓冲液消化，并通过差速离心分离成脂肪细胞和SVF。从脂肪细胞中提取细胞核进行snRNA-Seq，而SVF中的细胞进行scRNA-Seq。在ICELL8平台（Takara）上使用全长SMART-Seq技术对整个WAT、分离的脂肪细胞和人类SVF中的sc/snRNA-Seq进行了全面分析。

研究结论：
通过整个组织的snRNA-Seq、分离脂肪细胞的snRNA-Seq和SVF的scRNA- Seq来共同验证WAT的转录组成。由于每个细胞的覆盖深度，每组分析都超过了迄今为止在单细胞脂肪组织研究中发现的每个细胞/细胞核的基因数量，同时增强的基因覆盖率允许更准确地描述转录组，并识别脂肪生态位内的细胞类型。
分析结果表明，全WAT的snRNA序列提供了主要覆盖的细胞类型，识别了三个不同的脂肪细胞簇，并能够用拟时分析跟踪脂肪细胞分化。与WAT相比，脂肪细胞snRNA Seq无法匹配脂肪细胞异质性信息。SVF的scRNA-Seq结果提供了更高的非脂肪细胞分辨率。这些分析结果为单细胞全长转录分析在人类WAT和SVF中的应用提供了关键证据。

经验分享：
实验使用全长SMART-Seq技术，在每种类型的分析中实现了从5’端到3’端的强大基因覆盖。当使用从冷冻的人WAT中提取的细胞核时，全长SMART-Seq技术可以很好地分析脂肪生成的转录谱。此外，利用全长SMART-Seq单细胞技术，在使用相对较少的细胞的情况下，可以在人SVF中深入探索非脂肪细胞的多样性。

页面更新：2023-02-27 16:26:45