高通量单细胞全长转录组分析解决方案! | ||||||||
SMART-Seq Pro & ICELL8 cx平台联合分析 | ||||||||
全长序列覆盖可以实现对整个转录组的差异表达分析,并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。经深度优化推出的SMART-Seq Pro Application Kit(Cat No. 640257),具备良好的单细胞全长mRNA分析能力,在ICELL8 cx单细胞分析平台上的一张微孔芯片内,经过一系列分注和扩增步骤后,获得无偏倚的全长cDNA,并通过Illumina Bead-Linked Transposome(BLT)完成酶切片段化,同时引入Illumina特异性测序接头,可高效完成1,200~1,500个单细胞 (核)文库构建,完整的分析方案同时整合了生物信息学工具,为“藏珠于海”的转录水平稀有生物标志物发掘提供了有力工具。 | ||||||||
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ICELL8 cx Single-Cell System纳升级高通量自动化单细胞分析平台(点击获取产品手册) | ||||||||
※ 端到端的解决方案:从文库制备到测序数据分析工具 ※ 覆盖全长mRNA:捕获转录组中“深藏”的关键生物标志物,如基因融合、剪接异构体 ※ 高通量单细胞分析:可以平行地从>1,000个单细胞中生成测序数据 ※ 样品配置灵活:一次实验最多可对八种细胞样品进行分析 ※ 减少样品操作:减小数据波动,构建测序文库前ICELL8 cx平台自动鉴定并分选出您感兴趣的细胞,仅对这些细胞进行试剂分注 ※ Illumina平台测序文库:制备的测序文库适用于Illumina全系平台 ※ 易用的生物信息学分析工具:Cogent NGS Analysis Pipeline和Cogent NGS Discovery Software |
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旧版本:SMART-Seq® ICELL8® cx Application Kit 1 Chip(Cat No. 640222)仍可购买 | ||||||||
√性能展示 | ||||||||
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我们比较了SMART-Seq Pro与实验室自制方法SMART-seq2(SS2)在对低RNA含量的原代细胞(如PBMC)等不同细胞样本的检测敏感性差异,发现SMART-Seq Pro试剂盒识别并检测到的基因数量明显比SS2多,突出了SS Pro具有揭示罕见生物事件的能力。 |
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图A:基于转录本表达的人PBMC细胞簇 图B/C:选择性剪切产生的不同PTPRC亚型:PTPRC-201和PTPRC-209的不同表达水平 图D: 每个细胞簇中PTPRC同种亚型的不同表达水平 |
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SMART-Seq Pro除了可以对基因表达谱进行分析外,还具有检测不同PTPRC亚型转录水平的能力。通过SMART-Seq Pro进行全长转录分析,可额外获得3’端分析所遗漏的生物学信息,结合Congent NGS生信分析工具,提供对单细胞样本中重要生物标志物的高灵敏检测方案。 | ||||||||
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数据来源于Takara Bio USA, Inc. | ||||||||
自动化ICELL8 cx系统结合SMART Seq-Pro可以识别X公司系统上丢失的亚型表达数据。 |
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详情内容 点击下载 |
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√应用案例速享 | ||||||||
文献题目:Single cell full-length transcriptome of human subcutaneous adipose tissue reveals unique and heterogeneous cell populations |
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发表期刊:iScience |
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发表时间:2022年8月19日 |
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发表机构: AdventHealth translational research institute, Icahn School of Medicine |
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方案设计: |
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研究结论: |
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经验分享: |
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页面更新:2023-02-27 16:26:45