单细胞测序遇到瓶颈?是时候解锁单细胞核测序技术了! | ||
众所周知,群体测序可能会掩盖稀有细胞类型等重要生物学现象,因此越来越多的研究人员转向单细胞测序,以更好地了解单个细胞如何在整个复杂生物学系统中起作用。 其中单细胞转录组测序(scRNA-Seq),在生物及医学研究领域有着非常广泛的应用。但随着研究和应用的深入,其技术局限性也逐渐凸显。总结下来有:scRNA-seq主要适用于新鲜组织样本,而不能用于难解离的组织或冻存组织等;另外,不同类型细胞在解离效率上存在差异,细胞解离过程可能会导致无法有效获取到组织中的所有细胞类型。 那么为了克服这些困难,一个不错的替代策略是使用单细胞核转录组测序(single-nuclei RNA-Seq,snRNA-Seq)。 不同于常规的scRNA-Seq,snRNA-Seq是直接抽提细胞核,并对细胞核进行后续的转录组测序分析。由于不受解离条件的限制,snRNA-Seq的方法拓宽了冻存样本的利用价值,也适合于一些难解离的样本。同时更容易获得更加全面的细胞类型,更好地反应原始组织中的细胞组成和基因表达情况。 |
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不过单细胞核的mRNA含量要低得多,想要获得高品质的测序结果,需要选择合适的技术。Takara的SMART-Seq技术,轻松为您snRNA-Seq分析保驾护航! | ||
■ SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing(SMART-Seq v4) | ||
·灵敏度高的cDNA合成:非常适用于研究1-1000个细胞或10 pg-10 ng 总RNA,可检测更多基因 ·支持更深度的挖掘分析:保留全长基因信息,可用于差异表达、融合基因、点突变等的研究 ·节约宝贵时间:单管操作流程,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差 |
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更多snRNA-Seq应用,请见以下文献的实力测评 | ||
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■ 拓展产品信息:SMART-Seq v4 PLUS Kit | ||
·不只是一个Kit,更是完整的单细胞建库体验:在包含SMART-Seq v4基础上,整合包含片段化酶的建库模块! ·小投入,大产出,构建更高品质Illumina文库:文库产量和转录本检测数双双飙升! ·高质量的RNA-Seq数据:保留全长基因信息,低rRNA比率,高基因检出数,有效扩增GC-rich转录本! |
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■ 结语 | ||
snRNA-Seq的出现,能够弥补scRNA-Seq的局限性,为研究者提供更多的选择。 | ||
页面更新:2022-08-30 15:51:22