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cDNA样本偏差小 |
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在进行预扩增实验时,有多款预混型试剂可供选择。Prelude PreAmp Master Mix是进行无偏差预扩增实验的理想选择。为了比较Prelude PreAmp Master Mix和其他公司同类产品的性能,使用PrimerArray Cell cycle (Human) (Code No. PH002),分别对10个循环和14个循环预扩增的10 pg cDNA进行定量。另外三款同类预扩增试剂也使用其推荐的条件进行实验。以GAPDH为内参,计算ΔΔCt值,并根据下方文献中介绍的方法制图。使用±0.75的标准来判断扩增是否无偏向性。结果显示,Prelude PreAmp Master Mix的实验性能表现最好,96%(92/96)的数据在±0.75范围内。而其他三种同类产品都达不到,其中一些只有75%(72/96)的无偏差预扩增。实验结果表明,Prelude PreAmp Master Mix能够对少量起始样本进行无偏差的预扩增。 |
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请注意,虽然上图显示了PrimerArray Cell Cycle (Human) panel中全部96个目的基因的定量结果,但是为了保证可读性,x轴仅显示部分基因名称。完整的目的基因定量结果,详见Excel。 |
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Product |
No. assays within ±0.75 |
Percent bias |
Prelude PreAmp |
92/96 |
4% |
A公司 |
87/96 |
9% |
B公司 |
72/96 |
25% |
C公司 |
73/96 |
24% |
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我们的异常值减少了5-20%,表明预扩增的偏差更小。 |
Takara Bio USA, Inc.比较数据 |
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参考文献 |
Livak, K. J. & Schmittgen, T. D. Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR and the 2-ΔΔCT Method. Methods 25, 402–408 (2001). |
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