含有复杂结构的目的基因的扩增

 
■ 方法
Target:GFR II 基因516 bp(GC含量63.5%) 
样 品:人骨骼肌来源的全RNA 5 μg/RT液20 μl 
 
反转录反应液的制备
 
试剂 使用量
 2×Bca 1st Buffer 10 μl
 MgSO4 (25 mM) 4 μl
 dNTP Mixture(10 mM) 1 μl
 RNase Inhibitor 0.5 μl
 BcaBEST polymerase 1 μl
 Oligo dT Primer 1 μl
 样品RNA 1 μl
 RNase Free dH2O 1.5 μl
 Total 20 μl
 
反转录反应条件
 
 65℃  1 min 1 cycle
 30℃  5 min
 ↓  15 min
 65℃  15 min
 98℃  5 min
 5℃  5 min
 
 
PCR反应
 
A法(普通方法)
试剂 使用量
 MgSO4 (25 mM) 6 μl
 5 × Bca 2nd Buffer 16 μl
 Bca-Optimized Taq 0.5 μl
 上游PCR引物 1 μl

 下游PCR引物

1 μl
 灭菌水 55.5 μl
 Total 80 μl
 
B法
试剂 使用量
 MgSO4 (25 mM) 6 μl
 2×Bca1st Buffer 40 μl
 Bca-Optimized Taq 0.5 μl
 上游PCR引物 1 μl

 下游PCR引物

1 μl
 灭菌水 31.5 μl
 Total 80 μl
 
分别添加上述反应液(80 μl)和反转录反应后的产物(20μl)按照以下条件进行PCR反应。 
 
PCR反应条件
 
 94℃  1 min  
 94℃  30 sec 40 cycles
 60℃  30 sec
 72℃  1 min
 72℃  5 min  
 
■ 结果
使用A法(普通方法)未能得到扩增产物,但使用B法能够得到扩增产物。