PrimeScript RT-PCR Kit的实验操作(Code No.RR014A)

 
A. Template RNA变性及反转录反应
A-1 配制下列反应混合液
 
试剂 使用量
 dNTP Mixture(10 mM each) 1 μl
 Oligo dT Primer(2.5 μM)
 or Random 6 mers(20 μM)
 or Specific Primer(2 μM)*1
1 μl
 Template RNA*2
 or Positive Control RNA
[4×105 copies]
 RNase Free dH2O up to 10 μl
*1 合成cDNA的引物可结合实际情况从Oligo dT Primer、Random 6 mers、Specific Primer中任选一种(对于Control RNA,使用R-1 Primer)。
*2 Template RNA最多可加至8 μl,当使用Total RNA时,最多可加至5 μg (推荐使用量:100 pg~1 μg)。
 
A-2 在PCR仪上进行变性、退火反应
       65℃ 5 min
       4℃
NOTE:变性、退火操作有利于模板RNA的变性以及反转录引物和模板的特异性退火,可提高反转录反应效率。
 
A-3 在上述反应管中配制下列反转录反应液
 
试剂 使用量
 上述变性、退火后反应液 10 μl
 5×PrimeScript Buffer 4 μl
 RNase Inhibitor(40 U/μl) 0.5 μl
 PrimeScript RTase(for 2 Step) 0.5 μl
 RNase Free dH2O 5 μl
 Total Volume 20 μl
 
A-4 在PCR仪上按下列条件进行反转录反应
       (30℃              10 min.)*3
       42℃(~50℃)     15~30 min.
       95℃                5 min.*4
       4℃
 
*3 反转录反应引物为Random 6 mers时,此操作可使Random 6 mers在42℃ (~50℃) 和模板RNA充分退火、延伸,增加反转录效率。
*4 进行长片段DNA扩增时,为了保证1st strand cDNA完整,请进行70℃、15 min 的失活反应。。
 
NOTE:PrimeScript RTase对具有复杂二级结构的模板同样具有良好的延伸性能,通常可在42℃下进行反应。使用特异性下游引物进行反转录时,有时会因错配而产生非特异性扩增。此时可将温度升到50℃,可能会减少非特异性扩增。
 
B. PCR反应
B-1 按下列组成配制PCR反应液
 
试剂 使用量 Final concentration
 10×PCR Buffer Ⅱ 5 μl 1×  
 dNTP Mixture(10 mM each) 2 μl 400 μM
 Upstream Primer(20 μM)*5(Sense) 0.5 μl 0.2 μM
 Downstream Primer(20 μM)*6(Anti-sense) 0.5 μl 0.2 μM
 TaKaRa Ex Taq HS(5 U/μl) 0.5 μl  
 上述的反转录反应液 ≤5 μl  
 灭菌水 up to 50 μl  
*5 Positive Control RNA使用F-1 Primer。
*6 Positive Control RNA使用R-1 Primer。
 
B-2 按照下面的反应条件进行反应
 
一般反应条件
(A)三步法PCR的反应条件: 30 cycles (B)两步法PCR的反应条件: 30 cycles
94℃ 30 sec.   98℃ 10 sec.  
55~65℃ 30 sec.   68℃ 1 min./kb  
72℃ 1 min./kb    
 
Positive Control RNA*7的反应条件
94℃ 30 sec.   30 cycles
60℃ 30 sec.  
72℃ 1 min  
 
*7 在进行PCR扩增时使用Control Primer F-1和R-1引物,都可以得到462 bp的PCR扩增产物。