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PrimeScript™ RT-PCR Kit的实验操作(Code No.RR014A) |
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A. Template RNA变性及反转录反应 |
A-1 配制下列反应混合液 |
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试剂 |
使用量 |
dNTP Mixture(10 mM each) |
1 μl |
Oligo dT Primer(2.5 μM)
or Random 6 mers(20 μM)
or Specific Primer(2 μM)*1 |
1 μl |
Template RNA*2
or Positive Control RNA |
[4×105 copies] |
RNase Free dH2O |
up to 10 μl |
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*1 合成cDNA的引物可结合实际情况从Oligo dT Primer、Random 6 mers、Specific Primer中任选一种(对于Control RNA,使用R-1 Primer)。 |
*2 Template RNA最多可加至8 μl,当使用Total RNA时,最多可加至5 μg (推荐使用量:100 pg~1 μg)。 |
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A-2 在PCR仪上进行变性、退火反应 |
65℃ 5 min |
4℃ |
NOTE:变性、退火操作有利于模板RNA的变性以及反转录引物和模板的特异性退火,可提高反转录反应效率。 |
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A-3 在上述反应管中配制下列反转录反应液 |
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试剂 |
使用量 |
上述变性、退火后反应液 |
10 μl |
5×PrimeScript Buffer |
4 μl |
RNase Inhibitor(40 U/μl) |
0.5 μl |
PrimeScript RTase(for 2 Step) |
0.5 μl |
RNase Free dH2O |
5 μl |
Total Volume |
20 μl |
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A-4 在PCR仪上按下列条件进行反转录反应 |
(30℃ 10 min.)*3 |
42℃(~50℃) 15~30 min. |
95℃ 5 min.*4 |
4℃ |
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*3 反转录反应引物为Random 6 mers时,此操作可使Random 6 mers在42℃ (~50℃) 和模板RNA充分退火、延伸,增加反转录效率。 |
*4 进行长片段DNA扩增时,为了保证1st strand cDNA完整,请进行70℃、15 min 的失活反应。。 |
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NOTE:PrimeScript RTase对具有复杂二级结构的模板同样具有良好的延伸性能,通常可在42℃下进行反应。使用特异性下游引物进行反转录时,有时会因错配而产生非特异性扩增。此时可将温度升到50℃,可能会减少非特异性扩增。 |
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B. PCR反应 |
B-1 按下列组成配制PCR反应液 |
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试剂 |
使用量 |
Final concentration |
10×PCR Buffer Ⅱ |
5 μl |
1× |
dNTP Mixture(10 mM each) |
2 μl |
400 μM |
Upstream Primer(20 μM)*5(Sense) |
0.5 μl |
0.2 μM |
Downstream Primer(20 μM)*6(Anti-sense) |
0.5 μl |
0.2 μM |
TaKaRa Ex Taq HS(5 U/μl) |
0.5 μl |
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上述的反转录反应液 |
≤5 μl |
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灭菌水 |
up to 50 μl |
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*5 Positive Control RNA使用F-1 Primer。 |
*6 Positive Control RNA使用R-1 Primer。 |
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B-2 按照下面的反应条件进行反应 |
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一般反应条件 |
(A)三步法PCR的反应条件: |
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30 cycles |
(B)两步法PCR的反应条件: |
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30 cycles |
94℃ 30 sec. |
98℃ 10 sec. |
55~65℃ 30 sec. |
68℃ 1 min./kb |
72℃ 1 min./kb |
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Positive Control RNA*7的反应条件 |
94℃ 30 sec. |
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30 cycles |
60℃ 30 sec. |
72℃ 1 min |
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*7 在进行PCR扩增时使用Control Primer F-1和R-1引物,都可以得到462 bp的PCR扩增产物。 |
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