标准操作流程 (TaKaRa PCR Amplification Kit) | ||||||||||||||||||||||||||||
[使用TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice时] | ||||||||||||||||||||||||||||
A. 对照反应 | ||||||||||||||||||||||||||||
本试剂盒包含λDNA和扩增λDNA的6,012 bp及500 bp目的序列所需的引物。 | ||||||||||||||||||||||||||||
1. 按下述所示制备反应液。 | ||||||||||||||||||||||||||||
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* 依需要可以使用10×PCR Buffer(Mg2+ free)和MgCl2溶液替代。 | ||||||||||||||||||||||||||||
2. 将反应管放入TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice中。 | ||||||||||||||||||||||||||||
3. 按以下条件进行设定。 |
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使用Control Primer 1,2时(扩增6,012 bp) |
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使用Control Primer 1,3时(扩增500 bp) |
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按以上条件对Control Template的目的序列进行扩增。 |
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B. 样品反应 | ||||||||||||||||||||||||||||
实验过程大致与对照反应相同。 PCR反应一般以变性、退火、延伸3个阶段的温度变化为基础反应,但是当扩增长片段时(≥6kb),将退火与延伸合并进行2个阶段温度变化(shuttle PCR)的反应更适合。 但是,需要按照目的序列大小、引物大小及碱基序列设定变性、退火、延伸各步骤中的适宜条件(温度、时间)。 |
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C. 电泳 | ||||||||||||||||||||||||||||
反应结束后的溶液取5~10 μl加入1/6量6×Loading Buffer,样品加入到凝胶孔中,进行电泳。凝胶的种类及浓度依DNA的大小、目的不同区分使用。 电泳后的凝胶浸入1μg/ml溴乙锭溶液中20~30分钟,染色后紫外照射确认DNA条带。 |
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操作注意事项 | ||||||||||||||||||||||||||||
· 将试剂盒中的试剂混匀、离心后使用。注意, TaKaRa Taq需使用移液器轻柔混匀。此外,各试剂至使用前于冰上保存。 · 如果样品DNA中混有蛋白酶污染,可在热变性步骤之后加入TaKaRa Taq。将蛋白酶失活,防止TaKaRa Taq分解。 · 样品DNA的制备方法不同,10×PCR Buffer(Mg2+ plus)中Mg2+的浓度可能不合适。此时,需要使用10×PCR Buffer(Mg2+ free) 改变Mg2+浓度进行预实验,以确认适宜的Mg2+浓度。 |
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