TaKaRa Taq Hot Start Version(Code No. R007A/B)的操作方法

 
 
1. 在冰上按下列组份配制反应液。除模板(检测样品)外,将下列组份根据反应所需份数配制混合液,分装到反应管中,盖上反应管盖。
 
TaKaRa Taq Hot Start Version (5 U/μl) 0.25 μl
10×PCR Buffer (Mg2+ plus) 5 μl
dU plus dNTP Mixture*2 4 μl
MgCl2*2,3 1.5 μl
UNG*2,4 0.5 μl
Template < 500 ng
Primer 1 10~50 pmol  (终浓度0.2~1.0 μM)
Primer 2 10~50 pmol  (终浓度0.2~1.0 μM)
灭菌水 Up to 50 μl
 
*1 TaKaRa Taq Hot Start Version(Code No. R007A/B)中的附带试剂。
*2 TaKaRa PCR Carryover Prevention Kit中的试剂。
*3 因dUTP的浓度设定是dTTP的3倍,所以总体dNTP的浓度变高,虽然PCR Buffer中含有MgCl2,但为了保持MgCl2与dNTP量的平衡,要增加MgCl2浓度。使用10 × PCR Buffer (Mg+2 free) 时请添加4.5 μl MgCl2
*4 标准使用量:50 μl反应体系中添加1 U。
 
2. 模板(样品)的添加。
向1.的分装后反应液中添加模板(样品),盖紧反应管盖。
 
3. 轻微离心,将反应管放置到PCR扩增仪中。
 
4. UNG处理及PCR扩增。
先进行UNG处理,然后使UNG失活。随后按照PCR反应条件进行PCR扩增。根据扩增片段大小设定PCR反应条件。
 
<例如扩增1 kb DNA片段时>
           25℃?? 10 分钟(UNG处理)*1
           95℃?? 2 分钟(UNG的热失活)*1
98℃ 10 sec. *2   30 Cycles  
55℃ 30 sec.  
72℃ 1 min. *3  
*1 UNG酶处理条件不变,与扩增片段大小无关。
*2 PCR变性条件请根据PCR扩增仪种类及反应管种类进行设定。一般设定为98℃ 5~10 秒或94℃ 20~30 秒。
*3 使用dUTP替代dTTP,有时PCR扩增效率会有所下降,当扩增效率不良时,请延长延伸时间。
 
5. 将PCR扩增产物进行凝胶电泳等分析。