使用各公司PCR酶扩增亚硫酸氢盐处理后的DNA

 
【方法】
以亚硫酸氢盐处理后的HeLa基因组DNA为模板,使用TaKaRa EpiTaq HS及其他公司的PCR酶进行扩增。
(处理后的HeLa基因组DNA 100 ng/50 μl反应体系) 反应按以下条件进行。
 
亚硫酸氢盐处理:MethylEasy Xceed Rapid DNA Bisulphite Modification Kit(Code No. ME002)
目的基因:CDKN2ABRCA1 gene 上游的CpG 岛区域
扩增大小:144 bp (CDKN2A)、1,017 bp (BRCA1)
 
<反应液组成>
 
  使用量 终浓度
  亚硫酸氢盐处理HeLa 基因组DNA(50 ng/μl) 2 μl 100 ng/50 μl
  10 × EpiTaq PCR Buffer (Mg2+ free) 5 μl
  25 mM MgCl2 5 μl 2.5 mM
  dNTP Mixture(各2.5 mM) 6 μl 0.3 mM
  Sense Primer(20 μM) 1 μl 0.4 μM
  Antisense Primer(20 μM) 1 μl 0.4 μM
  TaKaRa EpiTaq HS(5 U/μl) 0.25 μl 1.25 U/50 μl
  灭菌水 up to 50 μl  
 
 
<PCR条件>
98℃ 10 sec.   40 cycles  
55℃ 30 sec.  
72℃ [30 sec.(144 bp)or 1 min.(1,017 bp)]  
 
(TaKaRa EpiTaq HS以外的其他试剂按各公司反应条件进行反应)
 
 
【结果】