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PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase |
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最适参数的设定 |
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为了发挥PrimeSTAR GXL DNA Polymerase的最大性能、获得良好的PCR扩增结果,有必要按照最适参数进行设定。 |
(1)Primer的设计 |
引物最好利用专业引物设计软件进行设计(选择最适的引物序列),如OLIGO™ Primer Analysis Software (Molecular Biology Insights, Inc.)。 |
【扩增DNA片段≦10 kb时】 |
一般引物长度为20-25 mer即可获得良好的扩增,当引物的Tm值(使用操作流程中的公式计算)在55℃以上,或引物长度在25 mer以上,可进一步提高PCR反应的成功率。使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase时,避免使用含次黄嘌呤核苷碱基(Inosine)的引物。 |
【扩增DNA片段>10 kb时】 |
建议引物Tm值在65℃以上,引物长度为25-35 mer,设计引物时3’端的GC含量不要过高。 |
【靶基因GC rich时】 |
建议引物的Tm值在60℃以上。 |
NOTE:使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase时,避免使用含次黄嘌呤核苷碱基(Inosine)的引物。 |
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(2)dNTP与Mg2+ |
由于dNTP具有螯合作用,dNTP浓度过高就会使实际参与反应的Mg2+浓度下降。 |
PrimeSTAR GXL DNA Polymerase配带的5×PrimeSTAR GXL Buffer中含有的Mg2+终浓度为1 mM、dNTP终浓度为200 μM each,是获得良好扩增结果的最适反应体系。尽量避免变更dNTP在反应体系中的浓度。 |
使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase时,不能用dUTP代替dTTP(使反应性能明显下降)。 |
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(3)模板 |
建议使用的模板量如下(50 μl反应体系): |
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(普通扩增时) |
(扩增大片段DNA时) |
人基因组DNA |
5 ng~500 ng |
100 ng~500 ng |
大肠杆菌基因组DNA |
100 pg~200 ng |
10ng~200 ng |
λDNA |
10 pg~10 ng |
1 ng~10 ng |
cDNA |
25 ng~750 ng |
250 ng~750 ng |
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* 亚硫酸氢盐处理后的含有尿嘧啶的DNA为模板时不能使用本制品。
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