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PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase |
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高速PCR操作流程 |
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1. PCR反应液的配制。 |
试剂 |
使用量 |
终浓度 |
5× PrimeSTAR GXL Buffer |
10 μl |
1× |
dNTP Mixture(2.5 mM each) |
4 μl |
200 μM each |
Primer 1 |
10-15 pmol |
0.2-0.3 μM* |
Primer 2 |
10-15 pmol |
0.2-0.3 μM* |
Template |
参考最适参数的设定(3) |
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PrimeSTAR GXL DNA Polymerase |
2 μl |
2.5 U/50 μl |
灭菌蒸馏水 |
up to 50 μl |
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* 扩增10 kb以上的大片段DNA时,引物的终浓度为0.2 μM。
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2. PCR反应条件。 |
【扩增DNA片段≦10 kb时】 |
98℃ |
10 sec. |
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30 Cycles [3-step PCR] |
55℃ or 60℃*1 |
15 sec. |
68℃*2 |
10 sec./kb |
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*1 Tm值(按照下面的公式计算)为55℃以上时→退火温度设定为60℃。
Tm值为55℃以下时→退火温度设定为55℃。
※ Tm值(℃)=[ (nA+nT) × 2 ]+[ (nC+nG) × 4 ]-5
n表示引物中碱基个数
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*2 进行3 step PCR反应时,也将Extension温度设定为68℃。
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【扩增DNA片段为10 kb-20 kb时】 |
98℃ |
10 sec. |
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30 cycles [2-step PCR] |
68℃ |
20 sec./kb |
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or |
98℃ |
10 sec. |
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30 Cycles [3-step PCR] |
60℃ |
15 sec. |
68℃ |
10 sec./kb |
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3. PCR反应条件的选择。 |
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① 扩增10 kb以下DNA片段时,请使用3 step PCR,不建议使用2 step PCR。 |
② 扩增10 kb以上DNA片段时,要想缩短反应时间,请使用3 step PCR;要想获得高特异性扩增,建议使用2 step PCR。 |
③ 对于GC rich模板,建议使用标准操作流程。 |
④ 无扩增产物或出现Smear、非特异性扩增产物时,请参照Troubleshooting进行调整。 |
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