|
|
PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase |
|
|
标准PCR操作流程
|
|
不仅介绍了延伸时间为1 min/kb的标准PCR反应操作流程,还介绍了DNA聚合酶的使用量为2倍、延伸时间为10 sec./kb的高速PCR反应的操作流程。
PCR反应液的配制可在室温下进行,但DNA聚合酶等各种试剂在配制前请于冰上放置。 |
|
1. PCR反应液的配制。 |
试剂 |
使用量 |
终浓度 |
5× PrimeSTAR GXL Buffer |
10 μl |
1× |
dNTP Mixture(2.5 mM each) |
4 μl |
200 μM each |
Primer 1 |
10-15 pmol |
0.2-0.3 μM* |
Primer 2 |
10-15 pmol |
0.2-0.3 μM* |
Template |
参考最适参数的设定(3) |
|
PrimeSTAR GXL DNA Polymerase |
1 μl |
1.25 U/50 μl |
灭菌蒸馏水 |
up to 50 μl |
|
|
|
* 扩增10 kb以上的大片段DNA时,引物的终浓度为0.2 μM。
|
|
2. PCR反应条件。 |
【扩增DNA片段≦10 kb时】 |
98℃ |
10 sec. |
|
30 Cycles [3-step PCR] |
55℃ or 60℃*1 |
15 sec. |
68℃*2 |
1 min./kb |
|
or |
98℃ |
10 sec. |
|
30 Cycles [2-step PCR] |
68℃ |
1 min./kb |
|
*1 Tm值(按照下面的公式计算)为55℃以上时→退火温度设定为60℃。
Tm值为55℃以下时→退火温度设定为55℃。
※ Tm值(℃)=[ (nA+nT) × 2 ]+[ (nC+nG) × 4 ]-5
n表示引物中碱基个数 |
*2 进行2 step PCR和3 step PCR反应时,均可以将Extension温度设定为68℃。
|
【扩增DNA片段为10 kb-30 kb时】 |
98℃ |
10 sec. |
|
30 Cycles |
68℃ |
10 min |
|
【扩增DNA片段为≧30 kb时】 |
98℃ |
10 sec. |
|
30 Cycles |
68℃ |
15 min |
|
|
3. PCR反应条件的选择。 |
|
① 扩增10 kb以下DNA片段时,请先尝试3 step PCR。 |
② 对GC rich模板或扩增10 kb以上DNA片段时,推荐使用2 step PCR。 |
③ 无扩增产物或出现Smear、非特异性扩增产物时,请参考Troubleshooting进行调整。 |
|
|