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PrimeSTAR HS® DNA Polymerase |
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存在PCR反应阻害物(SDS、腐殖酸)时与其他酶的活性比较 |
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以怀疑有SDS及腐殖酸污染的DNA为模板进行PCR反应时,使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase可有效进行PCR扩增。 |
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(1)存在SDS时的酶活性 |
有时以含SDS的检测样品为模板进行PCR反应。因PrimeSTAR HS DNA Polymerase不易受到SDS对PCR反应的阻害,所以含SDS的检测样品也可放心使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase。 |
使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase和Taq DNA Polymerase(rTaq),在PCR反应液中加入SDS后对SDS对PCR反应的阻害进行了研讨。反应体系以E. coli 基因组DNA为模板,扩增1.5 kb DNA片段。 |
使用rTaq,反应体系中的SDS终浓度为0.005%时,完全阻害PCR反应。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase,即使反应体系中的SDS终浓度为0.01%时也可扩增。 |
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(A)使用rTaq (B)使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase |
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图 存在SDS时的PCR反应 |
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Lane M: |
λ-Hind III digest |
Lane 1: |
未添加SDS和模板 |
Lane 2: |
SDS终浓度为0.01% |
Lane 3: |
SDS终浓度为0.005% |
Lane 4: |
SDS终浓度为0.002% |
Lane 5: |
SDS终浓度为0.001% |
Lane 6: |
未添加SDS |
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(2)存在腐殖酸时的酶活性 |
近来研究经常使用从土壤等环境样品直接提取的DNA进行分析。使用这种方法提取的DNA作为检测样品进行PCR反应时,必须注意要防止腐殖酸的污染。腐殖酸在土壤中分为2部分,一部分溶于碱,一部分不溶于酸,除土壤外海底堆积物等含有的红褐色或黑褐色的有机物。即使微量的腐殖酸也对PCP反应有很强阻害作用。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase即使存在腐殖酸也能发挥酶的活性,可检测的检测样品范围。将粗提的腐殖酸液(土壤提取液)*稀释后加入到PCR反应液中,使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase和rTaq对腐殖酸对PCR反应的阻害进行了研讨。反应体系以E. coli 基因组DNA为模板,扩增1.5 kb DNA片段。 |
使用rTaq,即使添加0.01μl腐殖酸时也有很强的阻害作用。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase,添加0.01 μl腐殖酸时与未添加腐殖酸的PCR同样可以进行扩增。因此,对于含SDS和腐殖酸污染的DNA模板,PrimeSTAR HS DNA Polymerase也能有效扩增。 |
*:腐殖酸不是标准的试剂,是从土壤中用碱溶出后,经酸溶液沉淀,再用碱溶液溶解获得。原液A280=10、A700=0。 |
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(A)使用rTaq |
(B)使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase |
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图 存在腐殖酸时的PCR反应 |
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Lane M: |
λ-Hind III digest |
Lane 1: |
未添加腐殖酸和模板 |
Lane 2: |
腐殖酸溶液添加量0.1 μl |
Lane 3: |
腐殖酸溶液添加量0.01 μl |
Lane 4: |
腐殖酸溶液添加量0.001 μl |
Lane 5: |
腐殖酸溶液添加量0.0001 μl |
Lane 6: |
未添加腐殖酸 |
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