无标题文档
PrimeSTAR HS® DNA Polymerase

存在PCR反应阻害物(SDS、腐殖酸)时与其他酶的活性比较
 
     以怀疑有SDS及腐殖酸污染的DNA为模板进行PCR反应时,使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase可有效进行PCR扩增。
 
(1)存在SDS时的酶活性
     有时以含SDS的检测样品为模板进行PCR反应。因PrimeSTAR HS DNA Polymerase不易受到SDS对PCR反应的阻害,所以含SDS的检测样品也可放心使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase。
     使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase和Taq DNA Polymerase(rTaq),在PCR反应液中加入SDS后对SDS对PCR反应的阻害进行了研讨。反应体系以E. coli 基因组DNA为模板,扩增1.5 kb DNA片段。
     使用rTaq,反应体系中的SDS终浓度为0.005%时,完全阻害PCR反应。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase,即使反应体系中的SDS终浓度为0.01%时也可扩增。
 
                               (A)使用rTaq           (B)使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase
图 存在SDS时的PCR反应
 
Lane M: λ-Hind III digest
Lane 1: 未添加SDS和模板
Lane 2: SDS终浓度为0.01%
Lane 3: SDS终浓度为0.005%
Lane 4: SDS终浓度为0.002%
Lane 5: SDS终浓度为0.001%
Lane 6: 未添加SDS
 
(2)存在腐殖酸时的酶活性
     近来研究经常使用从土壤等环境样品直接提取的DNA进行分析。使用这种方法提取的DNA作为检测样品进行PCR反应时,必须注意要防止腐殖酸的污染。腐殖酸在土壤中分为2部分,一部分溶于碱,一部分不溶于酸,除土壤外海底堆积物等含有的红褐色或黑褐色的有机物。即使微量的腐殖酸也对PCP反应有很强阻害作用。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase即使存在腐殖酸也能发挥酶的活性,可检测的检测样品范围。将粗提的腐殖酸液(土壤提取液)*稀释后加入到PCR反应液中,使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase和rTaq对腐殖酸对PCR反应的阻害进行了研讨。反应体系以E. coli 基因组DNA为模板,扩增1.5 kb DNA片段。
     使用rTaq,即使添加0.01μl腐殖酸时也有很强的阻害作用。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase,添加0.01 μl腐殖酸时与未添加腐殖酸的PCR同样可以进行扩增。因此,对于含SDS和腐殖酸污染的DNA模板,PrimeSTAR HS DNA Polymerase也能有效扩增。
     *:腐殖酸不是标准的试剂,是从土壤中用碱溶出后,经酸溶液沉淀,再用碱溶液溶解获得。原液A280=10、A700=0。
 
   (A)使用rTaq    (B)使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase
图 存在腐殖酸时的PCR反应
 
Lane M: λ-Hind III digest
Lane 1: 未添加腐殖酸和模板
Lane 2: 腐殖酸溶液添加量0.1 μl
Lane 3: 腐殖酸溶液添加量0.01 μl
Lane 4: 腐殖酸溶液添加量0.001 μl
Lane 5: 腐殖酸溶液添加量0.0001 μl
Lane 6: 未添加腐殖酸