TaKaRa Taq

TaKaRa TaqE.coli基因组DNA的污染检测
 
    目前,市场上销售的Taq DNA Polymerase几乎均是经过克隆转化到E.coli中进行表达后,分离提取得到的,那么就可能存在E.coli基因组DNA导致的内源性污染。实验中使用E.coli来源的DNA混入量最低的高品质的Taq DNA Polymerase尤为重要。
    下面是为了检测TaKaRa Taq和其他公司的Taq DNA Polymerase(标准级别)的E.coli基因组DNA污染,针对ori区域进行了巢式PCR扩增例。
    从图2结果来看,TaKaRa Taq中没有E.coli基因组DNA的扩增片段,但其他公司的Taq DNA Polymerase(标准级别)有ori区域(143 bp)的扩增片段。通过泳道9的扩增结果也可以证明Taq DNA Polymerase(标准级别)中有E.coli的基因组DNA的扩增。
    从以下结果看出,TaKaRa Taq中的E.coli基因组DNA量很少,在巢式PCR扩增检测界限1-10 fg以下,证明TaKaRa Taq的品质高于其他公司标准级别的Taq DNA Polymerase。
 
   图1:E. coli基因组的Ori区域和引物设计
 
 
   图2:2nd PCR反应的结果
 
Lane       Template量
Lane 1 :       0 negative test
Lane 2 :       0
Lane 3 :       0
Lane 4 :       0
Lane 5 :       0
Lane 6 :       1 pg positive control
Lane 7 :       100 fg
Lane 8 :       10 fg
Lane 9 :       1 fg
 
扩增区域:  E. coli. ori region
目的片段大小:  2nd PCR 143bp
M:  pHY Marker(Code No. 3404A/B)各8 μl电泳
     泳道6-9作为阳性对照,在1st PCR时分别加入1 pg、100 fg、10 fg 、1 fg E. coli JM109基因组DNA后进行了巢式PCR。