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产品选择指南

技术服务信息

当前位置:首页 > 技术资料 > 相关问答 > Clontech > NGS相关制品问答 > ThruPLEX® Plasma-Seq Kit
Q-1:ThruPLEX Plasma-Seq Kit可以使用的样品种类有哪些?
A-1:

ThruPLEX Plasma-Seq Kit是用于从血浆中纯化的cell-free DNA起始合成Illumina公司NGS用的DNA文库试剂盒。ThruPLEX Plasma-Seq Kit可以扩增高GC覆盖的多样性文库,以1~30 ng的cell-free DNA起始即可得到再现性好的结果。

 
用途 起始样品的种类 推荐起始量
血浆来源DNA的测序?液体活检;ctDNA分析,target测序 血浆中纯化的cell-free DNA 1~30 ng
 
Q-2:ThruPLEX Plasma-Seq Kit 和ThruPLEX DNA-Seq Kit有什么区别?
A-2:

ThruPLEX Plasma-Seq Kit是适用于血浆来源纯化的Cell-free DNA的试剂盒。不需要Cell-free DNA的片段化,两者的操作方法也不同(参照Q3)。

Q-3:ThruPLEX Plasma-Seq Kit与ThruPLEX DNA-Seq Kit的protocol有哪些不同?
A-3:

·模板制备过程:反应体积和反应温度不同。
·文库合成过程:反应体积和反应温度不同。
·文库扩增过程:反应体积和扩增循环数不同。

Q-4:ThruPLEX Plasma-Seq Kit的试剂可否与ThruPLEX DNA-Seq Kit中的试剂替换使用?
A-4:

不可以。

Q-5:是否有推荐用于血浆来源的cell-free DNA的纯化方法?
A-5:

可以使用QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit(Qiagen公司、Code No.55114)制备cell-free DNA。
溶解起始DNA使用的缓冲液中的Tris及EDTA的浓度,注意分别不要超过10 mM和0.1 mM。不可以使用含有磷酸盐的缓冲液。

Q-6:采血时,使用什么类型的采血管?
A-6:

Vacutainer Venous Blood Collection Tubes with K2 EDTA(Becton Dickinson公司、Code No. 36643)。
详细流程请参考Plasma preparation for the ThruPLEX Plasma-Seq workflow

Q-7:如何从血液中获取血浆?
A-7:

血浆需要使用桌面离心机从血液中分离。制备好的血浆样品,请于-80℃保存。
详细流程请参考Plasma preparation for the ThruPLEX Plasma-Seq workflow

Q-8:尿液或者其他活检液体纯化得到的cell-free DNA是否可以使用ThruPLEX Plasma-Seq Kit?
A-8:

ThruPLEX Plasma-Seq Kit适用于从血浆中分离得到的cell-free DNA,对于其他体液来源的降解DNA也有可能适用。使用血浆以外的其他样品时,首先必须使用DNA提取/纯化试剂盒提取cell-free DNA。此类样品来源的cell-free DNA通常已降解为DNA片段,因此不需要片段化处理。另外,需注意各反应中加入的cell-free DNA不能超过10 μl。

Q-9:与ThruPLEX Plasma-Seq Kit搭配使用的Target富集系统有哪些?
A-9:

ThruPLEX Plasma-Seq Kit能够与Agilent SureSelect、Roche NimbleGen SeqCap EZ等主要的exome和target富集产品组合使用。

页面更新:2019-11-12 16:03:07