ThruPLEX Plasma-Seq Kit是用于从血浆中纯化的cell-free DNA起始合成Illumina公司NGS用的DNA文库试剂盒。ThruPLEX Plasma-Seq Kit可以扩增高GC覆盖的多样性文库,以1~30 ng的cell-free DNA起始即可得到再现性好的结果。
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ThruPLEX Plasma-Seq Kit是适用于血浆来源纯化的Cell-free DNA的试剂盒。不需要Cell-free DNA的片段化,两者的操作方法也不同(参照Q3)。
·模板制备过程:反应体积和反应温度不同。
·文库合成过程:反应体积和反应温度不同。
·文库扩增过程:反应体积和扩增循环数不同。
不可以。
可以使用QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit(Qiagen公司、Code No.55114)制备cell-free DNA。
溶解起始DNA使用的缓冲液中的Tris及EDTA的浓度,注意分别不要超过10 mM和0.1 mM。不可以使用含有磷酸盐的缓冲液。
Vacutainer Venous Blood Collection Tubes with K2 EDTA(Becton Dickinson公司、Code No. 36643)。
详细流程请参考Plasma preparation for the ThruPLEX Plasma-Seq workflow。
血浆需要使用桌面离心机从血液中分离。制备好的血浆样品,请于-80℃保存。
详细流程请参考Plasma preparation for the ThruPLEX Plasma-Seq workflow。
ThruPLEX Plasma-Seq Kit适用于从血浆中分离得到的cell-free DNA,对于其他体液来源的降解DNA也有可能适用。使用血浆以外的其他样品时,首先必须使用DNA提取/纯化试剂盒提取cell-free DNA。此类样品来源的cell-free DNA通常已降解为DNA片段,因此不需要片段化处理。另外,需注意各反应中加入的cell-free DNA不能超过10 μl。
ThruPLEX Plasma-Seq Kit能够与Agilent SureSelect、Roche NimbleGen SeqCap EZ等主要的exome和target富集产品组合使用。
页面更新:2019-11-12 16:03:07