我们推荐从新鲜的培养细胞中进行提取。但从本公司的实验结果看,进行3次冻融处理的培养细胞也能提取检出片断化DNA,但收量明显减少。
请将样品分装后在-20℃以下保存,尽量避免反复冻融。本公司的实验结果表明:-20℃至少1个月稳定;4℃保存时,至少7天稳定。
可以考虑以下原因:
1. 细胞凋亡进行过度,有非特异性的DNA片段。推荐提早取样时间。
2. 操作中混入DNase。应防止DNase混入(如实验戴手套等)。
可以考虑以下原因:
1. 没有发生细胞凋亡。可使用In situ Apoptosis Detection Kit(Code No. MK500)等确认细胞凋亡是否发生。
2. DNA量太少,无法检出。增加处理样品的细胞数或者尽可能使用少量的TE Buffer溶解提取样品DNA。
用细胞刮勺剥离较好,与使用Trypsin剥离细胞方法相比,前者剥离的细胞的片断化DNA Ladder较为清晰。
在40℃左右加热,即可溶解。溶解后的溶液可以正常使用,不影响实验结果。
正常使用,6×Loading Buffer没有问题。
适用于大部分培养细胞,也适用于其特性类似于培养细胞的细胞,比如使用BD Vacutainer® CPT (Becton Dickinson)从全血或者脾中提取的淋巴细胞。但本试剂盒不适用于组织。
细胞凋亡产生的DNA片断化受以下因素影响:靶细胞、诱导剂及其浓度和诱导的时间等。另外,最近有报道说产生了细胞凋亡也可能没有产生DNA片断化。该问题没有确切的答案。根据本公司的经验,推荐使用1 mM星型胞菌素(Sigma,Code No. S4400)处理的HL60细胞作为验证提取成功的对照。
<使用HL60细胞实验例>
在90 mm培养皿中,加入10 ml培养基,接种107个HL60细胞,然后加入星型胞菌素,使其终浓度为3 μM。在37℃、5%CO2条件下培养5小时*,全量离心回收细胞。
用PBS(-) Buffer清洗一次后,使其悬浮于少量的PBS(-) Buffer中,将5×106个细胞移入1.5 ml Microtube中,1,600×g室温离心5分钟。得到的片断化DNA最终用20 μl TE Buffer溶解。取其中5 μl用3% Agarose Gel电泳检测。
*:细胞的不同培养状态下星型胞菌素的作用效果也不同。图1中的ladder是对星型胞菌素处理3~5小时得到的结果。
推荐使用3%的NuSieve® 3:1 Agarose (Lonza Rockland)。
页面更新:2020-05-11 15:55:22