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当前位置:首页 > 技术资料 > 相关问答 > Takara > 核酸提取纯化及DNA标记 > RNAiso for Small RNA
Q-1:使用RNAiso for Small RNA一般情况下的组织或细胞中所能提取的RNA量是多少?
A-1:一般情况下组织或细胞中所能提取的Small RNA量如下表(表中所指提取量指提取得到的Small RNA Fragments进行OD定量的结果,其提取量并不代表miRNA含量,且不同组织来源的Small RNA含量差别较大):
组织材料 起始样品量 Small RNA提取量
肝脏 100 mg 约50 μg
HL-60培养细胞 1×107 约15 μg
骨骼肌 100 mg 约15 μg
 
Q-2:有关RNA的吸光度说明如下:
A-2:

260 nm、320 nm、230 nm、280 nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白质等有机物的吸光度值。OD260/OD280(R)体现了RNA中的蛋白质等有机物的污染程度,质量较好的RNA的R值应在1.8~2.2之间,当R<1.8时,溶液中的蛋白质等有机物的污染比较明显;当R> 2.2时,说明RNA已经被水解成了单核苷酸。
在对核酸进行吸光度检测时,需要注意稀释液应使用TE Buffer。

Q-3:如何计算RNA的浓度?
A-3:

RNA浓度=(OD260-OD320)×稀释倍数×0.04 μg/μl。

Q-4:Small RNA提取量较低怎么办?
A-4:

① 向组织材料中加入RNAiso for Small RNA后,请充分研磨匀浆使其充分裂解。
② 相分离后请尽量完全回收上清液。
③ 增加起始组织加量,并成比例添加RNAiso for Small RNA。

Q-5:提取的Small RNA不溶怎么办?
A-5:

① 75%乙醇清洗沉淀后不要干燥时间过长或加热干燥。
② 可以于60℃加热5分钟后再于冰上溶解数小时。
③ RNA沉淀中含有不溶的蛋白质混合物时,应注意在相分离后吸取上清液时,避免枪头接触蛋白层。
④ 溶解液更换为0.5%的SDS溶液(DEPC处理水配制)。

Q-6:OD260/OD280值<1.65,为什么?
A-6:

① RNA应使用TE Buffer稀释后再进行吸光度值的测定,低离子强度或低pH值会使OD280值升高。
② 样品裂解时加入的RNAiso for Small RNA量偏少,造成蛋白质变性不充分,可以再次对Small RNA溶液进行苯酚/氯仿抽提,以除去蛋白质。
③ 含有裂解液的样品经匀浆混匀后未在室温静置,或静置的时间不足5分钟。
④ 相分离后,吸取上清液时不小心接触蛋白层造成污染。
⑤ RNA未充分溶解。

Q-7:提取的RNAiso for Small RNA降解,为什么?
A-7:

① 使用的组织材料不够新鲜。提取RNA的组织材料应采用新鲜的组织材料,或将新鲜的组织材料用液氮迅速冷冻后置于-80℃保存。
② 提取RNA时使用的试剂及器材中混有RNA分解酶。
③ 提取的组织材料中含有大量的RNA分解酶,而RNAiso for Small RNA的添加量不够。

Q-8:提取的RNA中含有DNA污染,为什么?
A-8:

① 裂解组织或细胞使用的RNAiso for Small RNA量偏少。
② 使用的组织材料中含有大量的有机溶剂(如:乙醇、异丙醇等)、高浓度的Buffer、碱性溶剂等。
③ 如果提取的RNA中含有DNA时,可以使用Recombinant DNase I(RNase-free)(Code No.2270A)进行DNA消化。

页面更新:2020-05-06 11:36:36