大多数的植物及动物肌肉组织中都含有大量多糖,因此很难将其从RNA中除去,使用此类组织材料提取RNA时,建议增加RNAiso Plus的使用量。
对于从含有大量多糖的植物样本中提取RNA时,推荐使用Fruit-mate for RNA Purification (Code No. 9192)作为预处理试剂。在异丙醇沉淀纯化步骤中加入High-Salt Solution for Precipitation (Plant) (Code No. 9193)可有效除去RNA溶液中的多糖。
1. RNA应使用TE Buffer稀释后再进行吸光度值的测定,低离子强度或低pH值会使OD280值升高
2. 样品裂解时加入的RNAiso Plus量偏少,造成蛋白分离不充分,可以再次对RNA溶液进行处理,以除去蛋白。
3. 含有裂解液的样品经匀浆混匀后未在室温静置,或静置的时间不足5分钟。这一步是从核酸中分离核蛋白的重要步骤。
4. 相分离后,吸取上清液时不小心接触蛋白层造成污染。
5. RNA未充分溶解。
RNA浓度=(OD260-OD320)×稀释倍数×0.04 μg/μl。
提取的RNA不溶,有以下几点原因:
1.75%乙醇清洗沉淀后不要干燥时间过长或加热干燥。
2.可以于60℃加热5分钟后再于冰上溶解数小时。
提取的RNA降解,有以下几点原因:
1.使用的组织材料不够新鲜。提取RNA的组织材料应采用新鲜的组织材料,或将新鲜组织材料用液氮迅速冷冻后置于-80℃保存。
2.提取RNA时使用的试剂及器材中混有RNA分解酶。
3.提取的组织材料中含有大量的RNA分解酶,而RNAiso Plus的添加量不够。
提取的RNA中含有DNA污染,有以下几点原因:
1.裂解组织或细胞使用的RNAiso Plus量偏少。
2.使用的组织材料中含有大量的有机溶剂(如:乙醇、异丙醇等)、高浓度的Buffer、碱性溶剂等。
3.如果提取的RNA中含有DNA时,可以使用Recombinant DNase I(RNase Free)(Code No. 270A)进行DNA消化。
不一定。上清液的颜色与提取的材料种类有关系,有的时候会因为带有材料本身的色素而带有一定的颜色,但是经过后续的纯化,提取的RNA一般不会带有颜色的,不影响RNA的纯度。
不同材料的RNA提取量请见下表:
组织材料 | 起始样品量 | Total RNA提取量 |
全血 | 1 ml | 15~20 μg |
白细胞 | 1×107个 | 约20~40 μg |
小鼠肝脏 | 1 g | 约4,000~5,000 μg |
HL-60培养细胞 | 1×107个 | 约100 μg |
烟草叶片 | 1 g | 约1,000 μg |
小鼠肾脏 | 1 g | 约3,000 μg |
小鼠骨骼肌 | 1 g | 约1,500 μg |
小鼠脑 | 1 g | 约1,500 μg |
鲤鱼骨骼肌 | 1 g | 约50 μg |
页面更新:2020-04-30 11:07:48