各种Reverse Transcriptase的区别如下:
|
||||||||||||||||||||
合成不了长链cDNA的原因如下:
1. RNase的原因(cDNA的电泳谱带出现模糊)。
对使用的器具、试剂请尽可能干热或者湿热灭菌处理。同时,在反应时请加入Recombinant RNase Inhibitor。
2. 反应条件不适合(cDNA的合成量少)。
请通过预备实验探讨适合的反应条件,此时所要研讨的项目包括:酶量、盐浓度、反应温度(37~65℃)、DTT浓度(0.5~10 mM)。
3. RNA结构上的问题(出现低分子带)。
尝试提高反应温度,请使用随机引物。
使用Recombinant RNase Inhibitor要注意以下问题:
1. 抑制活性的pH值范围较广,在pH7~8时表现最大活性。
2. 不要稀释使用。蛋白浓度过低易失活,而搅拌更易失活,因此建议尽量使用原液填加到反应体系中。
3. 起泡或强烈搅拌(Vortex等)会引起失活。
4. 不抑制RNase H活性。
使用例
cDNA第一条链的合成。
1. 在微量离心管中配制下列反应液,全量为20 μl。
模板RNA | 1 | μg | |
5 × Reverse Transcriptase XL Buffer* | 4 | μl | |
dNTP Mixture(10 mM each) | 2 | μl | |
Oligo(dT)18 Primer或Random Primer(6-9 mer) | 50 | pmol | |
Recombinant RNase Inhibitor | 20 | U | |
AMV Rtase | 5 | U | |
DEPC H2O | Up to 20 | μl | |
* AMV(Code No. 2621)制品中附有。 |
2. 轻轻搅拌。
3. 室温下10分钟放置后,移入42℃恒温槽中。
4. 42℃保温1小时。
5. 把样品移入冰中冷却2分钟。
(得到的反应液可用于cDNA第二条链的合成。)
页面更新:2020-04-27 10:40:10