高通量单细胞全基因组扩增
Shasta Whole-Genome Amplification Kit |
· 利用出色的PicoPLEX试剂,一次运行分析多达1,500单细胞
· 获得全基因组覆盖,检测片段化(segmental)CNV和染色体臂水平CNV
· 可以对SNV进行生物信息学分析
· 便捷的自动化工作流程
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■ 应用
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· 单细胞分辨率CNV检测
· 肿瘤亚克隆分析
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温馨提示:Shasta™ Whole-Genome Amplification Kit - 2 Chip(Code No. 640286)可适配仪器型号ICELL8 cx Single-Cell System(Code No. 64188)、Shasta™ Single Cell System(Code No. 64282)
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■ 案例 |
· 在不同染色体和细胞系中检测不同的拷贝数分布
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图1. 来自GM05067、GM22601、GM12878、K562细胞的单细胞拷贝数分析案例。
黑色线段表示片段中位数。分析结果显示,GM05067细胞4号染色体上出现拷贝数丢失,9号染色体上拷贝数增加,2倍体GM12878未检测出CNVs。K562细胞检测结果显示出超倍性,一种快速增值癌症细胞的常见现象。
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图2. 通过拷贝数分析结果的不同区分各种细胞类型
GM05067,GM22601,A_498,SKBR3的单细胞拷贝数分析聚类热图显示了每种细胞类型的不同模式,如GM05067(绿色)9号染色体有拷贝数增加,GM22601(红色)4号染色体有拷贝数缺失。
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(数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
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