单细胞总RNA测序分析
Shasta Total RNA-Seq Kit |
· 一次运行可以对5,000-10,000个细胞制备全长RNA测序文库
· 获取总RNA信息(mRNA、lncRNA等)
· 完整的基因体覆盖鉴定变异(剪切、基因融合等)
· 2天的工作流程
|
|
|
|
■ 应用
|
· 完整基因体(gene body)覆盖
· 新型生物标志物发现
|
温馨提示:Shasta™ Total RNA-Seq Kit - 2 Chip(Code No. 640288)可适配仪器型号ICELL8 cx Single-Cell System(Code No. 64188)、Shasta™ Single Cell System(Code No. 64282)
|
|
■ 案例 |
· 利用全长转录组分析鉴定新型癌症生物标志物
|
使用Shasta Total RNA-Seq Kit在一次运行中对超过100,000细胞进行全长转录组分析。显示barcode等级排列的拐点图展示了使用该应用所处理的K562细胞数量。红色虚线表示Cogent NGS工具在细胞鉴定时所设定的阈值。
|
|
|
· 基于lncRNA表达注释不同细胞类型
|
图A,UMAP图显示了A549细胞系通过不同的lncRNA表达分析形成不同的聚类。同基因(isogenic)A549细胞包括经模拟治疗处理的野生型A549细胞(WT,Cyan)、模拟治疗敲除p53的A549细胞(KO,Orange)、表观遗传治疗处理的野生型A549(WT_T,Purple)、表观遗传治疗处理的p53 KO A549细胞(KO_T,Green)。图B,对比表观遗传治疗和模拟治疗的野生型A549细胞与p53敲除处理的A549细胞中lncRNA PURPL的富集表达情况。
|
|
|
|
产品详情请点击: |
|
|
|