ChIP Elute Kit 和DNA SMART ChIP-Seq Kit—
以微量DNA模板构建Illumina测序文库 |
· 快速的(1h)DNA洗脱和ChIP解交联
· 无需接头连接即可构建ChIP-seq 文库
· DNA起始样品灵活:100 pg–10 ng ssDNA或dsDNA
· 4 h左右即可构建Illumina-ready测序文库
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有3种规格可以选择:
· DNA SMART ChIP-Seq Kit-12 包含1条正向引物和12条反向indexing引物,
最多可以构建12个indexed文库
· DNA SMART ChIP-Seq Kit-48 A 包含第一组4条正向引物和12条反向indexing引物,
最多可构建48个indexed文库
· DNA SMART ChIP-Seq Kit-48 B 包含第二组4条正向引物和12条反向indexing引物,
最多可以构建48个indexed文库
ChIP Elute Kit采用快速、简便的方法将染色质免疫沉淀实验(ChIP)获得的DNA进行解交联,洗脱和纯化,替代了长时间、繁琐的ChIP实验后期操作。单链DNA(ssDNA)回收只需1 h左右(传统方法通常需要过夜)并可直接用于DNA SMART ChIP-Seq Kit实验。
DNA SMART ChIP-Seq Kit无需接头连接即可在DNA片段末端添加Illumina®专用测序接头。由于ChIP实验获得DNA量比较少,构建ChIP测序(ChIP-seq)文库通常比较困难,尤其是抗体是针对低丰度转录因子时。DNA SMART ChIP-Seq Kit可以从100 pg–10 ng DNA起始构建测序文库用于Illumina平台测序。无论是ChIP实验获得的ssDNA还是双链DNA(dsDNA)都可直接用于DNA SMART ChIP-Seq Kit,从而兼容ChIP Elute Kit或其他方法。本试剂灵敏度高,操作时间少,只需4 h即可从微量DNA起始构建高质量测序文库。
DNA SMART ChIP-Seq Kit采用Takara全新的适用于DNA模板的专利SMART技术(日本专利第 6336080号),构建下一代测序(NGS)文库用于Illumina平台测序。DNA SMART ChIP-Seq Kit的核心模板转换技术,可以微量样品起始,无需接头连接即可添加Illumina测序接头。 |
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图1. DNA SMART ChIP-Seq Kit技术流程 |
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表1. 采用ChIP Elute和传统解交联方法获得DNA构建文库测序数据比较 |
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表2. 不同DNA起始量主要测序数据 |
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Technote:
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