■ 海报资源 |
Takara Bio R&D团队定期参加各种学术会议,为各种科学的讨论贡献我们的力量。点击阅读以下海报资源,了解Takara Bio如何不断推进单细胞研究。 |
利用SMART技术进行高通量单细胞TCR分析 |
High-throughput single-cell T-cell receptor profiling by SMART technology |
内容简介: |
单细胞TCR克隆型分析可以完成对每一个细胞所表达的特异性α-β受体链配对信息的测定。受体链配对信息能够帮助研究人员深入了解T细胞异质性和可塑性,有助于确定配对信息对单个细胞TCR抗原特异性的影响,对治疗性抗体的设计起到辅助作用。海报中案例采用类似5’RACE的方法和SMART技术,基于96孔板和ICELL8 Single-Cell System自动化单细胞系统两种方式,对单细胞TCR可变区全长进行了捕获建库,并对分析数据进行了展示。 |
利用ICELL8系统进行单细胞全长转录组分析数据展示 |
High-throughput single-cell RNA-, DNA-, and ATAC-seq |
内容简介: |
对于检测单细胞并解决细胞亚群问题(如,与耐药、细胞更新相关的亚群)的渴望,总是与单细胞分离技术的改进相伴而行。同时,对自动化单细胞处理系统的需求也从未停止,研究人员希望无论什么类型或尺寸的细胞都能得到处理、可以适用高质量试剂进行可靠的NGS样品制备、可以降低批次效应影响,提升可重复性。ICELL8单细胞分选系统可以满足以上需求。 ICELL8系统专注于单细胞的分离和分选,并搭配有高质量NGS试剂盒。基于泊松分布原理,ICELL8系统将细胞样品悬液分注到微孔芯片中,并通过荧光显微成像将捕获到单细胞的微孔挑选出来。液体分注器孔径达125 μm,可以快速地完成最多8种单细胞样品的处理,并将建库试剂选择性地加入特定微孔中。一张芯片可获得1,200~1,700个单细胞。芯片上所有微孔可以通过Hoechst、PI荧光通道进行图像检测,确认细胞活性等状态。通过海报内容对使用ICELL8系统完成的单细胞全长转录分析进行了灵敏性与可重复性展示。 |
利用SMART-Seq方法在ICELL8 cx Single-Cell System上进行可靠、灵敏的单细胞高通量融合基因检测 |
Robust and sensitive detection of gene fusions using high-throughput SMART-Seq chemistry on the ICELL8 cx system |
内容简介: |
高通量地分选细胞并获得单细胞全长转录本信息,对于需要丰富单细胞数据的科研团队来说越来越重要。通过ICELL8 cx Single-Cell System运行的自动化SMART-Seq流程可以满足对单细胞全长转录本信息的需求,该方法能够提供更多转录本末端捕获方法无法提供的重要信息。 海报内容展示了通过自动化SMART-Seq工作流程捕获融合基因连接reads(Junction reads)和跨越reads(spanning reads)的情况。通过这种自动化的全长mRNA-seq方法可以对乳腺癌细胞中的基因融合事件进行可靠的鉴定。 |
利用开放性设计的ICELL8 cx Single-Cell System进行定制化单细胞NGS方案开发 |
Development of custom single-cell assay protocols using the ICELL8 cx system and open architecture |
内容简介: |
在临床研究以及各类应用领域中使用二代测序技术时,要求能够同时对大量样品进行准确处理,并且有配套试剂能够可靠地完成文库制备。关于单细胞以及核酸相关的研究发展迅速,其中一个挑战性问题就是找到一个能够支持研究领域动态变化需求的仪器平台。 海报内容将向您展示利用ICELL8技术、成像功能及CELLSTUDIO软件成功开发的多种单细胞分析流程案例。 |
SMART-Seq Pro 新一代单细胞全长转录组分析 |
Development of a complete, end-to-end, automated single-cell system for biomarker discovery |
内容简介: |
全长序列覆盖可以实现对整个转录组的差异表达分析,并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。经深度优化推出的SMART-Seq Pro Application Kit(旧版本:SMART-Seq Application Kit),具备良好的单细胞全长mRNA分析能力,在ICELL8 cx单细胞平台上一张微孔芯片可同时完成1,200~1,500个单细胞 (核)文库构建,并整合了生物信息学工具,为“藏珠于海”的转录水平稀有生物标志物发掘提供了有力工具。 海报内容比较了SMART-Seq Pro与实验室自制方法SMART-seq2(SS2)的检测敏感性差异,发现SMART Seq Pro试剂盒检测到的基因数量明显比SS2多,同时SSPro还能够正确识别PTPRC基因的临床相关剪接体,突出了SSPro具有揭示罕见生物事件的能力。此外,SSPro还成功识别了被3'末端分析所遗漏的PTPRC亚型。以上实验数据说明SSPro能够识别临床相关异构体,同时结合Cogent NGS生信分析工具,提供对单细胞样本中重要生物标志物的高灵敏检测方案。 |
页面更新:2023-03-03 14:52:39