Takara真香推荐—简便好用的液态活检解决方案之游离DNA篇 |
在肿瘤早期筛查研究领域,循环肿瘤DNA(ctDNA)一直是各大厂商、科研工作者关注的重点。虽然ctDNA的应用日趋成熟,但总有一些微量的ctDNA样本无法用传统技术完成高品质文库的构建,特别是在进行肿瘤早期诊断有重要价值的稀有突变分析时。 如何以微量ctDNA起始构建可准确分析稀有突变的文库?Takara的解决方案是引入分子标签技术! |
■ 微量ctDNA样本无法准确分析稀有变异? 自带1600万分子标签的建库技术了解一下 |
ThruPLEX Tag-Seq Kit是Takara推出的采用茎环形接头,含1600万种分子标签的DNA-Seq文库构建技术,足以准确区分是测序错误还是真实的稀有突变! |
同时,该产品支持1-50 ng cfDNA起始,微量样本的文库构建不再是难题! ThruPLEX单管操作、手动15 min、总共两小时,过程中无需转管与纯化,实验小白也能轻松上手! |
● 实验案例 |
分别以10 ng及30 ng的cfDNA标准样品(Horizon Diagnostics)起始,使用ThruPLEX Tag-seq kit制备文库,然后使用Agilent SureSelect靶向序列富集系统定制Panel(110 KB),或Roche的NimbleGen SeqCap EZ定制Panel(240 KB)进行富集,使用illumina的NGS平台进行测序。得到的数据使用Curio(Curio Genomics)分析。 |
使用Agilent (30 ng DNA input)或Roche(10 ng DNA input)两者中的任意一个靶向富集系统时,可以得到与已知的MAF(Minor Allele Frequency)同等的结果。 |
(数据来源于Takara Bio USA, Inc.) |
加量不加价,白送的知识点与讲座,还不赶快Get? ↓ |
● 实验友好型的ctDNA稀有突变分析方案 |
可能有些刚开展ctDNA稀有变异分析项目的朋友会有所担心,即便能简便快捷地构建NGS文库,但后期如果没有易用的生信分析流程,一样会成为项目研发的阻碍。 |
No Worries!以下三款生信分析工具,搭配ThruPLEX Tag-Seq使用,效果更佳! |
Connor:GitHub平台上一款开放型的生信工具,可以处理ThruPLEX Tag-Seq文库的测序数据。Connor可以aligned BAM文件作为输入量,分析分子标签信息,并生成含对应序列的BAM文件,后续可结合突变分析软件进行分析,如FreeBayes等。 Curio:Curio Genomics公司所推出的基于“云”的生信平台,ThruPLEX Tag-Seq文库的测序数据可以上传、处理及可视化。该平台运行速度快,用户界面友好,具有强大的Alignment Viewer。同时,Curio整合了变异检测、分析及可视化的模块,方便用户使用。 Strand NGS:由Strand Life Sciences推出的原生支持ThruPLEX Tag-Seq数据分析的生信平台,提供NGS数据的分析、管理及可视化。 |
● 精彩讲座 |
在本次在线讲座中,来自威斯康辛医学院的病理与分子遗传学教授Dr. Liang Wang将分享他近期用NGS技术分析cfDNA,用以鉴定前列腺癌、肺癌和结肠癌生物标志物的研究成果。其中,Dr. Liang Wang采用ThruPLEX技术构建cfDNA样品的NGS文库。 |
温馨提示:以上内容,如果您感兴趣,请联系我们进行详细咨询: wangmin@takarabiomed.com.cn |
关联阅读 |
液态活检解决方案之游离RNA篇 |
页面更新:2023-04-18 09:18:57