液态活检解决方案之游离RNA篇

机构用户解决方案

产品选择指南

一般PCR相关制品

PCR Enzyme的选择 PCR原理说明高成功率PCR优选酶：TaKaRa Ex Premier 高保真酶：PrimeSTAR系列基本PCR：Taq、Ex Taq、LA Taq系列无需提取的直接PCR：MightyAmp系列菌落PCR、预混染料的PCR酶特殊用途：多重PCR，防污染等高端PCR酶（Clontech） DNA PCR相关制品 RT-PCR试剂盒具备反转录活性的PCR酶：TaKaRa Tth PCR仪器
等温扩增相关制品

等温扩增酶
定量PCR相关制品

qPCR学习中心 qPCR套装反转录反应（qPCR专用）反转录反应试剂(Clontech) 嵌合荧光法检测(Takara) 嵌合荧光法检测(Clontech) miRNA 嵌合荧光法检测探针检测 Cycleave探针检测 qPCR－仪器 qPCR Primer qPCR－RNA/DNA的制备
cDNA合成 & 克隆

克隆学习中心 DNA Ligation TA克隆和平滑末端克隆 In-Fusion无缝克隆 cDNA合成&文库构建 SMART全长cDNA合成&文库构建 Random Mutagenesis Site-Directed Mutagenesis 基因组DNA序列调取试剂盒 Vector（克隆用）感受态细胞修饰酶/Ligases 修饰酶/磷酸酶、激酶修饰酶/DNA & RNA Polymerase 修饰酶/焦磷酸酶修饰酶/RTase、RNase Inhibitor 修饰酶/核酸酶、拓扑异构酶 Nucleotide Buffer（Powder）etc. 用于mRNA生产的酶（HQ级） Others（基因工程相关制品）
NGS相关制品

NGS 学习中心单细胞 RNA-Seq 单细胞 DNA-Seq RNA-Seq DNA-Seq 生殖健康表观遗传学分析免疫库分析单细胞分选系统 NGS关联制品 PCR酶（NGS用）
自动化系统

自动化学习中心高通量单细胞分选系统ICELL8 cx 及其应用高通量Real-Time PCR系统自动化NGS文库制备系统高通量单细胞分选系统ICELL8应用
核酸提取、纯化及DNA标记

DNA片段、质粒DNA纯化基因组DNA纯化试剂(柱式法) 基因组DNA纯化试剂(试剂型) RNA提取、纯化试剂(柱式法) RNA提取、纯化试剂(试剂型) RNA保存试剂 Small RNA提取试剂体液样品exosome提取试剂病毒核酸纯化试剂盒酵母核酸纯化试剂盒核酸提取及纯化制品-Others DNA标记标记DNA-蛋白质的回收
限制酶

限制酶基本信息常规限制酶系列产品 QuickCut限制酶 RNA限制酶
电泳相关制品

核酸染料 DNA Markers RNA Markers 蛋白质Markers Agarose Loading Buffer 常用缓冲液方便装电泳相关装置
蛋白质互作研究（酵母杂交系统）

Takara酵母杂交学习中心 Matchmaker^® Gold酵母双杂系统 Matchmaker^® Gold酵母单杂系统互作的确认和评价 Matchmaker相关制品
表达调节及蛋白质性能分析

iDimerize^™蛋白质互作诱导系统 ProteoTuner^™蛋白质调节系统 Tet诱导表达系统
蛋白质表达相关制品

E.coli蛋白质表达 Brevibacillus/Bacillus蛋白质表达哺乳动物细胞蛋白质表达昆虫细胞蛋白质合成(Clontech) 无细胞蛋白质合成系统 Protein Refolding
蛋白质纯化、分析和检测

Capturem新型膜技术应用蛋白质样品制备 His标签融合蛋白质纯化 GST标签融合蛋白质纯化生物素标签融合蛋白质纯化 DYKDDDDK标签融合蛋白质纯化 Myc标签融合蛋白质纯化抗体纯化蛋白质IP&Co-IP 糖/磷酸化蛋白质纯化蛋白质检测蛋白质电泳胶染色蛋白质定量蛋白酶（His标签去除）蛋白酶（氨基酸序列分析）
基因导入（Virus、Vectors）

病毒基因传递系统选择向导重组慢病毒(Lentivirus)制品重组逆转录病毒(Retrovirus)制品重组腺相关病毒(AAV)制品重组腺病毒(Adenovirus)制品哺乳动物细胞用载体酵母、丝状真菌用载体植物用载体
转染试剂

Xfect转染试剂选择向导质粒转染试剂 RNA转染试剂 Protein转染试剂
干细胞研究相关制品

干细胞学习中心干细胞基因操作 (Cell reprogramming) 细胞 (Cell) 细胞培养产品 (Cell culture) 抗体 (Antibodies) 分化试剂盒和多能性监测 (Pluripotency and Differentiation ) 基因编辑（Gene Editing）
表观遗传学相关制品

甲基化DNA富集相关制品 PCR/qPCR相关制品 Control Genome DNA 甲基化DNA相关酶制品亚硫酸氢盐处理相关制品
基因组编辑相关制品

CRISPR/Cas9 Cre重组酶基因敲入用长单链DNA制备
荧光蛋白质 & 报告系统

荧光蛋白质按颜色、名称分类荧光蛋白质按用途分类荧光蛋白质相关制品报告系统
抗体 & ELISA & 细胞信号转导

细胞增殖、细胞毒性测定细胞凋亡（Takara）细胞凋亡（Clontech） EIA试剂盒（Takara）免疫染色关联制品细胞信号转导（Clontech）酶活性测定试剂盒脂肪细胞、骨细胞分化试剂抗体（Takara）
细胞 & 培养相关制品

细胞培养相关制品细胞生物学检测试剂细胞解冻仪器
microRNA & RNAi研究相关制品

RNA合成提取及纯化制品 microRNA定量PCR miRNA表达 Small RNA克隆 shRNA表达检测合成siRNA定量 RNAi相关制品
Library & cDNA & RNA

Human cDNA libraries series Mouse cDNA libraries series Rat cDNA libraries series cDNA、Genome DNA Total RNA & Poly A⁺ RNA
糖工学相关制品

糖工学酶糖工学试剂盒 Glycosphingolipid解析试剂
应用检测（食品-环境-人）

活菌DNA检测相关制品防污染相关制品食物中毒检测（PCR）食物中毒检测 (Real Time PCR) 食物中毒检测 (按Target选择) 肉种鉴定相关制品水质检测人感染症检测菌种鉴定支原体检测
仪器相关制品

PCR仪器支持中心 Q-PCR仪 E-PCR仪电泳仪器产品
Clontech相关组分信息表

Clontech相关组分信息表

技术服务信息

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Takara真香推荐—简便好用的液态活检解决方案之游离RNA篇

液态活检适用于早期诊断以及指导用药、疗效与复发监控，所检测的特征物质包括游离核酸（cfDNA/cfRNA）、循环肿瘤细胞（CTC）、细胞外囊泡（EV）等。
其中，各大检测服务提供商、科研工作者对cfDNA、cfRNA的关注一直十分强烈。
cfDNA是液态活检领域最广泛检测的对象，尤其是游离在体液中的循环肿瘤DNA（ctDNA）。外周血中的ctDNA包含了癌基因/抑癌基因的突变、微卫星不稳定、后生遗传学变异等基因变异信息，现阶段主要通过高通量测序技术检测分析这些信息并应用于临床。
随着研究的不断深入，科研人员发现单纯的ctDNA检测不能全面反映疾病在RNA水平的生物活性，无法明确突变对细胞进程的影响。而RNA水平的检测能明确癌症在特定时间发生的变化，可定期监控疾病的发展及对治疗的反应，并预测身患同一癌症的不同个体将对不同疗法有何反应，因此受到广泛关注。

因此，不少液态活检工作者开始同时检测cfDNA与cfRNA两个水平的变化，联合分析提供更全面的临床数据。但是，在开发游离核酸项目时，研发人员常面临多种挑战：
(一）游离核酸在外周血中含量较低
(二）游离核酸稳定性、完整性不足，存在一定降解
(三）建库流程较长，操作繁琐，对实验员素质有更高要求

针对以上难点，Takara分别推出了可用于cfRNA、cfDNA的NGS解决方案，先一起了解如何突破cfRNA项目研发瓶颈！

先来看看cfRNA的提取

■ 用操作简便的RNAiso Blood提取cfRNA，纯度、产量都高！

好的RNA提取是做好一切RNA实验的基础，游离RNA由于其自身的特点需要更好的技术才能获得更高的纯度与产量。
RNAiso Blood是一种从人或动物的血液及含水量较高的植物中可简单、快速分离RNA的Total RNA提取试剂，全过程仅需1小时。提取的Total RNA纯度高，很少含蛋白质及基因组DNA，可以直接用于RT-PCR、Northern杂交、mRNA纯化、体外翻译等各种分子生物学实验。

● 实验流程

● 实验案例

使用本公司的RNAiso Blood、A公司试剂、B公司与C公司柱式法的产品提取人血液中的total RNA，并进行凝胶电泳分析，相关结果如下：

泳道	产品	OD260/280	每100 μl血液RNA收量（μg）
1,2	RNAiso Blood	1.76	2.62
3,4	A公司试剂	1.84	2.99
5,6	B公司产品（柱式）	1.98	0.57
7,8	C公司产品（柱式）	1.51	0.11

*数据来源：Takara Bio Inc.

再来看看cfRNA的文库构建

■ Takara SMARTer技术，助您突破游离RNA（cfRNA）项目研发瓶颈

游离RNA（cfRNA），是科研人员及各大NGS厂商近期重点关注的对象，由于其能反映DNA标志物的生物活性，对cfRNA的分析能提供更可靠的肿瘤、早产风险的预测数据，也有部分NGS厂商利用cfRNA进行临床宏转录组分析（mNGS）。cfRNA的文库构建是很关键又是非常困难的环节，选择性能优异的文库构建技术至关重要！

SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian，专为低质量样本设计的，无需进行rRNA前处理操作，可直接以体液样本中提取的total RNA起始，6小时内即可制备具有链特异性的高质量文库。简便快捷的操作，却带来了编码与非编码RNA的准确分析！

● 实验案例

近来，科研人员运用Pico v2的前一代产品SMARTer Stranded Total RNA-seq - Pico Input Mammalian kit（Pico v1）对母体血液中胎儿cfRNA建库、预测早产风险的研究成果发表于《Science》杂志，由其高达75-80%的准确率，受到了广泛关注。

而与Pico v1相比，Pico v2不仅文库纯化操作更方便，还大大提升了测序性能！不信您往下看。

上图为以150 pg和1 ng cfRNA起始，分别采用Pico v1和Pico v2构建文库进行测序分析。使用Pico v2的mapping率更高，核糖体和线粒体检出比例更低，基因检测数量更多，能进行更高灵敏度的分析。

温馨提示：以上内容，如果您感兴趣，请联系我们进行详细咨询：
wangmin@takarabiomed.com.cn

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页面更新：2020-11-26 16:14:36