TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2

机构用户解决方案

产品选择指南

一般PCR相关制品

PCR Enzyme的选择 PCR原理说明 Takara优选酶多功能酶高保真酶：PrimeSTAR系列基本PCR：Taq系列 Powerful PCR：MightyAmp系列直接电泳的酶制品特殊用途：多重PCR，防污染等高端PCR酶（Clontech） DNA PCR相关制品 RNA PCR相关制品 PCR Subtraction相关制品 PCR仪器
等温扩增相关制品

等温扩增酶
定量PCR相关制品

qPCR学习中心 qPCR套装反转录反应（qPCR专用）反转录反应试剂(Clontech) 嵌合荧光法检测(Takara) 嵌合荧光法检测(Clontech) miRNA 嵌合荧光法检测探针检测 Cycleave探针检测 qPCR－仪器 qPCR Primer qPCR－RNA/DNA的制备
cDNA合成 & 克隆

克隆学习中心 DNA Ligation TA克隆和平滑末端克隆 In-Fusion无缝克隆 cDNA合成&文库构建 SMART全长cDNA合成&文库构建 Random Mutagenesis Site-Directed Mutagenesis 基因组DNA序列调取试剂盒 Vector（克隆用）感受态细胞修饰酶/Ligases 修饰酶/磷酸酶、激酶修饰酶/DNA & RNA Polymerase 修饰酶/焦磷酸酶修饰酶/RTase、RNase Inhibitor 修饰酶/核酸酶、拓扑异构酶 Nucleotide Buffer（Powder）etc. 用于mRNA生产的酶（HQ级） Others（基因工程相关制品）
NGS相关制品

NGS 学习中心单细胞 RNA-Seq 单细胞 DNA-Seq RNA-Seq DNA-Seq 生殖健康表观遗传学分析免疫库分析单细胞分选系统 NGS关联制品 PCR酶（NGS用）前代RNA-Seq/DNA-Seq制品
自动化系统

自动化学习中心高通量单细胞分选系统ICELL8 cx 及其应用高通量Real-Time PCR系统自动化NGS文库制备系统高通量单细胞分选系统ICELL8应用
核酸提取、纯化及DNA标记

DNA片段、质粒DNA纯化基因组DNA纯化试剂(柱式法) 基因组DNA纯化试剂(试剂型) RNA提取、纯化试剂(柱式法) RNA提取、纯化试剂(试剂型) RNA保存试剂 Small RNA提取试剂体液样品exosome提取试剂病毒核酸纯化试剂盒酵母核酸纯化试剂盒核酸提取及纯化制品-Others DNA标记标记DNA-蛋白质的回收
限制酶

限制酶基本信息常规限制酶系列产品 QuickCut限制酶 RNA限制酶
电泳相关制品

核酸染料 DNA Markers RNA Markers 蛋白质Markers Agarose Loading Buffer 常用缓冲液方便装电泳相关装置
蛋白质互作研究（酵母杂交系统）

Takara酵母杂交学习中心 Matchmaker^® Gold酵母双杂系统 Matchmaker^® Gold酵母单杂系统互作的确认和评价 Matchmaker相关制品
表达调节及蛋白质性能分析

iDimerize^™蛋白质互作诱导系统 ProteoTuner^™蛋白质调节系统 Tet诱导表达系统
蛋白质表达相关制品

E.coli蛋白质表达 Brevibacillus/Bacillus蛋白质表达哺乳动物细胞蛋白质表达昆虫细胞蛋白质合成(Clontech) 无细胞蛋白质合成系统 Protein Refolding
蛋白质纯化、分析和检测

Capturem新型膜技术应用蛋白质样品制备 His标签融合蛋白质纯化 GST标签融合蛋白质纯化生物素标签融合蛋白质纯化 DYKDDDDK标签融合蛋白质纯化 Myc标签融合蛋白质纯化抗体纯化蛋白质IP&Co-IP 糖/磷酸化蛋白质纯化蛋白质检测蛋白质电泳胶染色蛋白质定量蛋白酶（His标签去除）蛋白酶（氨基酸序列分析）
基因导入（Virus、Vectors）

病毒基因传递系统选择向导重组慢病毒(Lentivirus)制品重组逆转录病毒(Retrovirus)制品重组腺相关病毒(AAV)制品重组腺病毒(Adenovirus)制品哺乳动物细胞用载体酵母、丝状真菌用载体植物用载体
转染试剂

Xfect转染试剂选择向导质粒转染试剂 RNA转染试剂 Protein转染试剂
干细胞研究相关制品

干细胞学习中心干细胞基因操作 (Cell reprogramming) 细胞 (Cell) 细胞培养产品 (Cell culture) 抗体 (Antibodies) 分化试剂盒和多能性监测 (Pluripotency and Differentiation ) 基因编辑（Gene Editing）
表观遗传学相关制品

甲基化DNA富集相关制品 PCR/qPCR相关制品 Control Genome DNA 甲基化DNA相关酶制品亚硫酸氢盐处理相关制品
基因组编辑相关制品

CRISPR/Cas9 Cre重组酶基因敲入用长单链DNA制备
荧光蛋白质 & 报告系统

荧光蛋白质按颜色、名称分类荧光蛋白质按用途分类荧光蛋白质相关制品报告系统
抗体 & ELISA & 细胞信号转导

细胞增殖、细胞毒性测定细胞凋亡（Takara）细胞凋亡（Clontech） EIA试剂盒（Takara）免疫染色关联制品细胞信号转导（Clontech）酶活性测定试剂盒脂肪细胞、骨细胞分化试剂抗体（Takara）
细胞 & 培养相关制品

细胞培养相关制品细胞生物学检测试剂细胞解冻仪器
microRNA & RNAi研究相关制品

RNA合成提取及纯化制品 microRNA定量PCR miRNA表达 Small RNA克隆 shRNA表达检测合成siRNA定量 RNAi相关制品
Library & cDNA & RNA

Human cDNA libraries series Mouse cDNA libraries series Rat cDNA libraries series cDNA、Genome DNA Total RNA & Poly A⁺ RNA
糖工学相关制品

糖工学酶糖工学试剂盒 Glycosphingolipid解析试剂
应用检测（食品-环境-人）

活菌DNA检测相关制品防污染相关制品食物中毒检测（PCR）食物中毒检测 (Real Time PCR) 食物中毒检测 (按Target选择) 肉种鉴定相关制品水质检测人感染症检测菌种鉴定支原体检测
仪器相关制品

PCR仪器支持中心 Q-PCR仪 E-PCR仪电泳仪器产品
Clontech相关组分信息表

Clontech相关组分信息表

技术服务信息

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TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634478	SMARTer^® Human TCR a/b Profiling Kit v2	12 Rxns	￥24,557
Clontech	634479	SMARTer^® Human TCR a/b Profiling Kit v2	48 Rxns	￥53,723

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无标题文档

· 适合不同起始量样本：支持total RNA(10 ng-1 μg外周血淋巴细胞来源或 1 ng-100 ng T细胞来源 total RNA)，或者纯化后完整的T细胞（1,000-10,000个）起始；
· 无需多对引物：每次反应仅需一对引物扩增相应的TCR亚基；
· 更灵敏特异的克隆型分析：优化的cDNA文库构建技术，确保克隆型的可靠分析；
· 添加UMI校正：引入UMI建库，校正PCR偏差及测序错误产生的reads；
· 更可靠的样本-数据拆析结果：整合UDI建库，在高通量型Illumina测序仪上有更好的样本拆析与测序可靠性；
· 更灵活的测序平台选择：可自由选择Miseq平台（分析V(D)J 全长信息），或是其它Illumina平台（分析CDR3区），支持最多192个样本同时测序；

■ 产品说明

T细胞是获得性免疫反应的重要组成部分，其表面受体蛋白（T cell receptors, TCRs）发挥着识别抗原分子的作用。NGS是解析TCR多样性的主流技术，对揭示个体获得性免疫反应的奥秘提供了宝贵的技术支撑。

SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 (TCRv2)是一款具有更高重复性和特异性的TCR NGS文库构建试剂盒。该试剂盒整合SMART（Switching Mechanism at 5' end of RNA Template）全长cDNA合成技术与5’RACE技术，可捕获TRA和TRB基因完整的V(D)J可变区，用于后续NGS分析。

TCRv2试剂盒支持不同input量的RNA（RIN≥8，取决于样本类型）或细胞起始，均可获得高品质的测序文库，如外周血淋巴细胞total RNA(10 ng-1 μg)、T细胞total RNA(1 ng-100 ng)，或纯化后完整的T细胞(1,000-10,000个)。文库中可同时包含α链和β链的多样性信息。

同时，TCRv2试剂盒包含UMI（Unique Molecular Identifier），用以去除PCR偏差及测序错误所产生的reads，提供更正确和可靠的结果。

相较于前代产品，TCRv2所建文库支持更多样的测序平台。既支持Miseq平台（分析V(D)J全长信息），也支持其它Illumina平台（分析CDR3区）。此外，TCRv2试剂盒还整合了UDI（Unique Dual Index），能更正确拆析采用图案化流动槽技术（Patterned flow cell）测序平台（如NovaSeq^™ system）的下机数据，同时也支持更多样本同时测序。

■ 建库原理

■ 不同起始量克隆型检测数据

图1 不同的RNA或者T细胞起始量，均能获得高灵敏性和重复性的克隆型检测数据

Takara科学家以1、10、100 ng 人CD3+ T细胞total RNA和1,000、10,000个CD3+T细胞制备TRA和TRB文库，测序reads用Cogent NGS Immune Profiler软件分析。结果显示，无论采用RNA还是以复杂度较高的T细胞直接起始，TCRv2试剂盒所建文库均能获得良好的克隆型检测数据。

■ 灵敏度测试数据

图2 Takara科学家向100 ng PBMC RNA样本中掺入不同浓度（10%，1%，0.1%，0.01%，0.001%和0.0001%）的Jurkat T细胞RNA（包含TRBV12-3-TRBJ1-2克隆型）。采用TCRv2试剂盒扩增TRB CDR3区域并制备文库、NextSeq系统测序。测序reads downsample至 2.5M reads。灰色标记的是所混入的Jurkat RNA检出下限，结果显示，在未通过UMI数据校正时，TRBV12-3的检测极限为0.01%，但是在UMI数据校正的情况下，检测极限下探至0.001%！

■ 同类产品比较实验

图3 为了比较不同TCR分析方法（DNA based VS RNA based）的性能差异，Takara科学家分别以TCRv2（RNA based, 5’RACE）、Company X（RNA based，接头连接法）、Company Y(DNA based, 多重PCR)作为文库构建方案。接着分离了500万个PBMC细胞作为gDNA和RNA的提取材料，并以1.6 μg gDNA和100 ng RNA制备文库，分析TCR a/b文库的克隆型数量。从结果中可以看出，TCRv2文库获得TRA和TRB基因平均4.87万和16.3万个克隆型检测数据，远高于Company X RNA方法及Company Y DNA方法所获得克隆型数量！

*NT Not Tested

数据来源于Takara Bio USA, Inc.

SMART Human TCR-Seq v2：
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页面更新：2024-01-31 13:53:04