|
ssDNA-Seq Kit |
■ 产品特点 |
· 构建兼容单链DNA(ssDNA)和双链DNA(dsDNA)的NGS文库
· 适用于高度片段化、受损或降解的DNA样本,比如FFPE样本
· 可对短至50 bp的ssDNA片段进行分析
· 流程简单,不到2小时即可完成文库制备
· 兼容Unique Dual Index试剂盒,可同时处理多达384个样本 |
|
■ 产品说明 |
在传统的双链DNA文库制备过程中无法捕获ssDNA。而本试剂盒支持从单链DNA和双链DNA中构建DNA文库,特别适用于含混合DNA形态的样本(包括FFPE DNA、环境来源DNA、以及损伤或降解的DNA样本)。
本试剂盒兼容低至10 pg的DNA起始量和短至50 bp的单链DNA片段。与传统的双链DNA-Seq流程不同,ssDNA-Seq Kit首先通过预处理和热变性步骤,将样本中所有DNA转化为单链形态。热变性后,使用单链DNA连接酶(SDL)在所有单链DNA片段的3'端添加第一个接头。随后通过引物延伸将文库转化为双链DNA,并在双链DNA片段的5'端添加第二个接头。最后使用Unique Dual Indexes(Code No. 634752–634756;单独销售)添加Illumina测序所需的接头,并进行文库扩增。整个过程2小时以内即可完成。
|
|
■ ssDNA-Seq Kit兼容的DNA样本类型 |
 |
|
■ ssDNA-Seq Kit兼容的DNA形式 |
|
 |
|
■ 流程概要 |
|
 |
图 1. ssDNA-Seq Kit流程示意图 |
|
■ 性能数据 |
|
 |
图2. 从人类基因组DNA(gDNA)和 FFPE 样本中制备的高质量文库
使用ssDNA-Seq Kit,从人gDNA 和不同片段化程度的FFPE来源DNA样本中制备DNA 文库。每个样本的起始量是10 ng DNA,使用Covaris进行片段化处理。通过TapeStation HD5000对制备的文库进行评估,结果显示所有样本均呈现预期的DNA文库的图谱,且不受初始片段化程度的影响。在NextSeq 2000仪器上进行双端测序(2×150 bp)后,使用 Bowtie2软件将测序结果比对至GRCh38参考基因组,结果表明,无论样本的片段化程度如何,其比对率均高达97%以上。注:DIN =DNA完整值。 |
|
|
产品详情请点击: |
|
|
|