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ThruPLEX® DNA-Seq HV
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech R400740 ThruPLEX® DNA-Seq HV 96 Rxns 询价
Clontech R400741 ThruPLEX® DNA-Seq HV 24 Rxns 询价
Clontech R400736 ThruPLEX® DNA-Seq HV Core Components 96 Rxns 询价
Clontech R400737 ThruPLEX® DNA-Seq HV Core Components 24 Rxns 询价
Clontech R400739 ThruPLEX® HV UDI 1-24 24 Rxns 询价
Clontech R400738 ThruPLEX® HV UDI Set A 96 Rxns 询价
 
高起始量通用型DNA-Seq分析
ThruPLEX® DNA-Seq HV
· 兼容更高起始量的多种样本:5至200 ng FFPE DNA、cfDNA起始,30 μl建库体积,无需浓缩样本!
· 删繁就简:单管三步操作流程,2 h内完成文库构建!
· 一致高效可靠:无畏起始量差异,高实验重复性、更均一的文库覆盖度,高GC含量区域偏差更小!
· 更适用于临床相关样本及肿瘤学研究等应用领域!
 
■ 产品说明
出色的NGS文库构建系统必须具备“流线型”、简便的操作流程,兼容更大的DNA起始量范围,同时还必须保证结果的可靠性。Takara科学家特别优化、研制的ThruPLEX DNA-Seq HV文库构建系统,具有流程完整、快速,文库复杂度高、结果可靠性高、兼容困难样本等特点。采用单管操作流程,市面上鲜有比ThruPLEX DNA-Seq HV流程更快速、更连贯、适合更高样本通量的产品。此外,没有同类产品的流程中需要耗时的磁珠纯化步骤,ThruPLEX DNA-Seq HV单管操作的设计能大大减少珍贵样本的损耗!使用时无需稀释接头,ThruPLEX DNA-Seq HV进一步减少了手动操作时间,删繁就简!
 
ThruPLEX DNA-Seq HV支持5-200 ng DNA起始,起始体积提升至30 μl,样本无需浓缩!通过这样的改进,ThruPLEX DNA-Seq HV所建文库能获得基因组覆盖度更高、突变检测更正确的测序数据。面对不同GC含量的样本,我们的系统都能产生覆盖度更均匀且一致的实验数据。
 
■ 流程简便,节约您的宝贵时间
Takara科学家分别采用5/200 ng DNA起始,比较了ThruPLEX DNA-Seq HV与其他品牌同类产品制备文库的操作流程,建库总时长为制备足量双端illumina文库的时间。从上表可以看出,ThruPLEX DNA-Seq HV是唯一采用单管操作、无需接头稀释且过程中无需磁珠纯化的系统,建库总时长与手动操作时间均为最短,操作最为便捷!
 
■ 不同GC含量,一致均匀覆盖
实现一致、均一的GC覆盖度并不容易,要求文库构建系统对不同GC含量的基因组都能提供正确、均一的覆盖。实验结果证明:无论是以gDNA还是以不同GC含量的实际样本起始,ThruPLEX DNA-Seq HV均能构建出GC覆盖度均一的文库!
 
 
■ “妥协”的FFPE 样本,不“妥协”的DNA-Seq性能
若要长期保存临床研究组织样本,往往需要福尔马林进行固定处理,处理后即为福尔马林石蜡包埋样本(FFPE)。但福尔马林会造成样本中的核酸降解,表现为核酸品质差、含量不足,致使后续的高品质文库构建出现困难。ThruPLEX DNA-Seq HV采用优化的技术与流程,无惧FFPE样本的挑战!
Takara科学家比较了ThruPLEX DNA-Seq HV与A公司的同类产品所建文库的测序数据,样本分别是50 ng与5 ng起始的formalin-compromised样本(模拟的FFPE样本)、30 ng与5 ng起始的FFPE样本,三次生物学重复。
 
图1 ThruPLEX DNA-Seq HV所建Formalin compromised文库具有更高的平均靶标覆盖度 两个试剂盒所建文库采用AMPure磁珠纯化、pool后用IDT xGEN Pan Cancer Panel (800kb human genome) 进行靶向富集, NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles) 双端测序。每个文库downsample为5M reads,bowtie2软件将数据align至hg19。VarDict Variant Caller进行突变分析,最低覆盖度30X,最低等位基因突变频率0.5%。
 
图2 ThruPLEX DNA-Seq HV所建FFPE文库能检测到更多的突变 两个试剂盒所建文库的测序数据,三次重复中至少有两次检测到阳性突变被计算为有效阳性突变。
 
 
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