SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian)

机构用户解决方案

产品选择指南

一般PCR相关制品

PCR Enzyme的选择 PCR原理说明高成功率PCR优选酶：TaKaRa Ex Premier 高保真酶：PrimeSTAR系列基本PCR：Taq、Ex Taq、LA Taq系列无需提取的直接PCR：MightyAmp系列菌落PCR、预混染料的PCR酶特殊用途：多重PCR，防污染等高端PCR酶（Clontech） DNA PCR相关制品 RT-PCR试剂盒具备反转录活性的PCR酶：TaKaRa Tth PCR仪器
等温扩增相关制品

等温扩增酶
定量PCR相关制品

qPCR套装 qPCR学习中心反转录反应（qPCR专用）反转录反应试剂(Clontech) 嵌合荧光法检测(Takara) 嵌合荧光法检测(Clontech) miRNA 嵌合荧光法检测探针检测 Cycleave探针检测 qPCR－仪器 qPCR Primer qPCR－RNA/DNA的制备
cDNA合成 & 克隆

克隆学习中心 DNA Ligation TA克隆和平滑末端克隆 In-Fusion无缝克隆 cDNA合成&文库构建 SMART全长cDNA合成&文库构建 Random Mutagenesis Site-Directed Mutagenesis 基因组DNA序列调取试剂盒 Vector（克隆用）感受态细胞修饰酶/Ligases 修饰酶/磷酸酶、激酶修饰酶/DNA & RNA Polymerase 修饰酶/焦磷酸酶修饰酶/RTase、RNase Inhibitor 修饰酶/核酸酶、拓扑异构酶 Nucleotide Buffer（Powder）etc. 用于mRNA生产的酶（HQ级） Others（基因工程相关制品）
NGS相关制品

NGS 学习中心单细胞 RNA-Seq 单细胞 DNA-Seq RNA-Seq DNA-Seq 生殖健康表观遗传学分析免疫库分析单细胞分选系统 NGS关联制品 PCR酶（NGS用）
自动化系统

自动化学习中心单细胞分选系统Shasta及其应用高通量单细胞分选系统ICELL8 cx 及其应用高通量Real-Time PCR系统高通量单细胞分选系统ICELL8应用
核酸提取、纯化及DNA标记

DNA片段、质粒DNA纯化基因组DNA纯化试剂(柱式法) 基因组DNA纯化试剂(试剂型) RNA提取、纯化试剂(柱式法) RNA提取、纯化试剂(试剂型) RNA保存试剂 Small RNA提取试剂体液样品exosome提取试剂病毒核酸纯化试剂盒酵母核酸纯化试剂盒核酸提取及纯化制品-Others DNA标记标记DNA-蛋白质的回收
限制酶

限制酶基本信息常规限制酶系列产品 QuickCut限制酶 RNA限制酶
电泳相关制品

核酸染料 DNA Markers RNA Markers 蛋白质Markers Agarose Loading Buffer 常用缓冲液方便装电泳相关装置
蛋白质互作研究（酵母杂交系统）

Takara酵母杂交学习中心 Matchmaker^® Gold酵母双杂系统 Matchmaker^® Gold酵母单杂系统互作的确认和评价 Matchmaker相关制品
表达调节及蛋白质性能分析

iDimerize^™蛋白质互作诱导系统 ProteoTuner^™蛋白质调节系统 Tet诱导表达系统
蛋白质表达相关制品

E.coli蛋白质表达 Brevibacillus/Bacillus蛋白质表达哺乳动物细胞蛋白质表达昆虫细胞蛋白质合成(Clontech) 无细胞蛋白质合成系统 Protein Refolding
蛋白质纯化、分析和检测

Capturem新型膜技术应用蛋白质样品制备 His标签融合蛋白质纯化 GST标签融合蛋白质纯化生物素标签融合蛋白质纯化 DYKDDDDK标签融合蛋白质纯化 Myc标签融合蛋白质纯化抗体纯化蛋白质IP&Co-IP 糖/磷酸化蛋白质纯化蛋白质检测蛋白质电泳胶染色蛋白质定量蛋白酶（His标签去除）蛋白酶（氨基酸序列分析）
基因导入（Virus、Vectors）

病毒基因传递系统选择向导重组慢病毒(Lentivirus)制品重组逆转录病毒(Retrovirus)制品重组腺相关病毒(AAV)制品重组腺病毒(Adenovirus)制品哺乳动物细胞用载体酵母、丝状真菌用载体植物用载体
转染试剂

Xfect转染试剂选择向导质粒转染试剂 RNA转染试剂 Protein转染试剂
干细胞研究相关制品

干细胞学习中心干细胞基因操作 (Cell reprogramming) 细胞 (Cell) 细胞培养产品 (Cell culture) 抗体 (Antibodies) 分化试剂盒和多能性监测 (Pluripotency and Differentiation )
表观遗传学相关制品

甲基化DNA富集相关制品 PCR/qPCR相关制品 Control Genome DNA 甲基化DNA相关酶制品亚硫酸氢盐处理相关制品
基因组编辑相关制品

CRISPR/Cas9 Cre重组酶基因敲入用长单链DNA制备
荧光蛋白质 & 报告系统

荧光蛋白质按颜色、名称分类荧光蛋白质按用途分类荧光蛋白质相关制品报告系统
抗体 & ELISA & 细胞信号转导

细胞增殖、细胞毒性测定细胞凋亡（Takara）细胞凋亡（Clontech） EIA试剂盒（Takara）免疫染色关联制品细胞信号转导（Clontech）酶活性测定试剂盒脂肪细胞、骨细胞分化试剂抗体（Takara）
细胞 & 培养相关制品

细胞培养相关制品细胞生物学检测试剂细胞解冻仪器
microRNA & RNAi研究相关制品

RNA合成提取及纯化制品 microRNA定量PCR miRNA表达 Small RNA克隆 shRNA表达检测合成siRNA定量 RNAi相关制品
Library & cDNA & RNA

Human cDNA libraries series Mouse cDNA libraries series Rat cDNA libraries series cDNA、Genome DNA Total RNA & Poly A⁺ RNA
糖工学相关制品

糖工学酶糖工学试剂盒 Glycosphingolipid解析试剂
应用检测（食品-环境-人）

活菌DNA检测相关制品防污染相关制品食物中毒检测（PCR）食物中毒检测 (Real Time PCR) 食物中毒检测 (按Target选择) 肉种鉴定相关制品水质检测人感染症检测菌种鉴定支原体检测
仪器相关制品

PCR仪器支持中心 Q-PCR仪 E-PCR仪电泳仪器产品
Clontech相关组分信息表

Clontech相关组分信息表

技术服务信息

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SMART-Seq^® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR^™ Mammalian)
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634354	SMART-Seq^® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR^™ Mammalian)	24 Rxns	￥18,658
Clontech	634355	SMART-Seq^® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR^™ Mammalian)	96 Rxns	￥52,243
Clontech	634356	SMART-Seq^® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR^™ Mammalian)	4 × 96 Rxns	￥189,454
Clontech	634756	Unique Dual Index Kit (1–24)	24 Rxns	￥2,737
Clontech	634752	Unique Dual Index Kit (1–96)	96 Rxns	￥7,370
Clontech	634753	Unique Dual Index Kit (97–192)	96 Rxns	￥7,370
Clontech	634754	Unique Dual Index Kit (193–288)	96 Rxns	￥7,370
Clontech	634755	Unique Dual Index Kit (289–384)	96 Rxns	￥7,370

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带UMI的微量样本的链特异RNA-Seq分析
SMART-Seq^® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR^™ Mammalian)

· 高灵敏度：可以人、大鼠或小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或10-1000个细胞起始
· 添加UMI：准确识别真正变异和罕见突变，并校正来自PCR和测序错误以及重复序列
· 用途广泛：能分析质量较差的FFPE、LCM以及cfRNA来源的样本，生成高再现性的数据
· 操作简便：仅需要6.5小时即可完成文库构建，改良buffer配方，缩短文库纯化时间

注：SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian) 是SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian的替代品，性能提升，如下所示：

i：提升ZapR技术去除rRNA cDNA效率，以更好地剔除不需要的reads信息
ii：试剂盒中不再包含index，但可以与Unique Dual Index (UDI) kits（24 Rxns，96 Rxns）灵活地搭配使用

■ 产品说明

SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian) 设计用于从皮克级总RNA (250 pg-10 ng) 中高效制备Illumina测序文库。本试剂盒适用于高品质、部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。本试剂盒采用一体化操作流程，保留了链来源信息，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。本试剂盒设计在反转录步骤增加8 nt UMI（Unique molecular identifier)，以降低PCR偏倚，并为转录本定量提供额外的信息，特别是对于真正的变异和罕见的突变。
该试剂盒结合了SMART(Switching Mechanism at the 5' end of RNA Template)技术，包括对链特异性RNA-Seq的SMART方法进行改良，简化了文库制备流程并提升了测序性能。该方法可用于高质量或低质量的总RNA，不需要前处理rRNA，并且生成的是保留链来源信息的测序文库。整合了去除核糖体RNA来源的cDNA（以total RNA起始生成的cDNA中呈高丰度）流程，使得操作流程非常灵敏，生成的数据再现性高，rRNA比对率低。
全部操作流程，包括文库准备和纯化，只需要大约6.5 h。

不同样品起始量解决方案
·10-100 ng总RNA，推荐使用SMART-Seq Total RNA Mid Input
·100 ng-1 μg总RNA，推荐使用SMART-Seq Total RNA High Input (RiboGone^™ Mammalian)

■ 流程概要

■ 性能数据

☆ 小鼠脑总RNA-seq文库的转录组分析
选择250 pg的小鼠脑RNA样本起始，使用SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理（+）和未处理（-），然后通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。最后使用CogentAP 对3x10⁶ PE reads进行数据分析。

Panel A的柱状图和Panel C的表格数据展示了文库的reads分布，Panel B的柱状图和Panel C展示了文库基因检测数等数据

☆ 原代B细胞来源的Total RNA转录组分析
选择10 ng的人原代B细胞来源的Total RNA样本起始，使用SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理（+）和未处理（-），然后通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。最后使用CogentAP 对3x10⁶ PE reads进行数据分析。

Panel A的柱状图和Panel B的表格数据分别展示了用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit处理（+）和未处理（-）的文库基因检测数和转录本检测数

☆ 降解FFPE样本起始，可有效去除rRNA来源cDNA，获得可靠的结果
使用本试剂盒制备10 ng FFPE RNA文库 (RIN=3, DV200=77%)。使用CogentAP进行数据分析，使用3x10⁶ PE reads进行数据分析。

Panel A的柱状图和Panel B的表格数据，展示了文库的reads分布和基因组检测数

☆ 提升ZapR技术去除rRNA cDNA 效率
选择250 pg的人脑RNA样本起始，使用SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理（+）和未处理（-），然后通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。同时，使用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian对250 pg的人脑RNA样本制备文库。最后使用CogentAP 对3x10⁶ PE reads进行数据分析。

与SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian制备的文库相比，SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian)制备的文库，rRNA相关reads百分比降低，外显子reads百分比增加。

产品详情请点击：

页面更新：2024-07-05 15:43:13