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高起始量链特异RNA-Seq分析SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 635046 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 24 Rxns ¥13,664
Clontech 635047 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 96 Rxns ¥45,547
Clontech 635045 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 4 x 96 Rxns ¥166,772
Clontech 634756 Unique Dual Index Kit (1–24) 24 Rxns 询价
Clontech 634752 Unique Dual Index Kit (1–96) 96 Rxns 询价
Clontech 634753 Unique Dual Index Kit (97–192) 96 Rxns 询价
Clontech 634754 Unique Dual Index Kit (193–288) 96 Rxns 询价
Clontech 634755 Unique Dual Index Kit (289–384) 96 Rxns 询价
无标题文档
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)
· 保留链来源信息:转录本的链来源识别准确率>99%
· 快速,简便流程:整个文库构建流程仅需5 h
· 起始范围广:适用于人,小鼠或大鼠100 ng-1 μg总RNA
· 样本兼容性广:兼容不同品质RNA,不同重复之间均可获得可靠数据。RIN值3-10的总RNA均可获得高质量重复数据
· 适用Illumina测序平台:最多支持同时构建384 UDI测序文库
注:本试剂盒不含index,可搭配使用Unique Dual Index (UDI) kits(单独销售)
 
■ 产品说明
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)可以提供从100 ng–1 μg哺乳动物总RNA构建Illumina测序文库的解决方案。本试剂结合了RiboGone和SMART技术,可以无缝融合rRNA去除和链特异性文库构建过程。
由于rRNA约占总RNA的90%,在文库构建前高效去除这些高丰度转录本可以降低测序成本,提升数据比对率。核心SMART技术可以在RT和PCR扩增过程中添加index和测序接头,无需下游文库构建,并且可以保留链来源信息。
 
不同样品起始量解决方案
· 250 pg-10 ng总RNA,推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 10-100 ng总RNA,推荐使用SMART-Seq Total RNA Mid Input
 
■ 建库原理
A:利用RiboGone技术从总RNA样品中去除rRNA
B:利用SMART技术合成第一链cDNA
C:通过PCR扩增生成测序文库
 
■ 不同品质的样本均可获得可靠的结果
选择不同品质(RIN3和RIN7)的小鼠肝脏RNA样本,分别以100 ng和1 μg的样本量起始,使用该试剂盒制备RNA-Seq文库。结果显示,不同起始量,不同品质的样本之间的测序mapping率以及基因检测数的差距不大。而且转录本的链识别率均在95%以上。
 
■ 再现性高
(1)样本重复之间的一致性
以100 ng的HURR样本起始,两次生物学重复,制备RNA-seq文库。散点图说明,两个重复之间的FPKMs的相关性高。
 
(2)不同品质RNA样本之间的一致性
选择不同品质(RIN3和RIN7)的小鼠肝脏RNA样本,以1 μg的样本量起始,分别使用该试剂盒制备RNA-Seq文库。散点图说明,不同品质RNA样本之间的FPKMs的相关性高。
 
注:
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)是SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian的等效替代品。只有如下细微变动,本次更新并不影响这些试剂盒的流程和性能。
· 灵活的选择:试剂盒中不包含index,但也可以与Unique Dual Index (UDI) kits搭配使用。
 
 
产品详情请点击:
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页面更新:2024-01-12 10:44:59

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