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高起始量链特异RNA-Seq分析SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 635046 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 24 Rxns ¥13,664
Clontech 635047 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 96 Rxns ¥45,547
Clontech 635045 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 4 x 96 Rxns ¥166,772
Clontech 634756 Unique Dual Index Kit (1–24) 24 Rxns ¥2,737
Clontech 634752 Unique Dual Index Kit (1–96) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634753 Unique Dual Index Kit (97–192) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634754 Unique Dual Index Kit (193–288) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634755 Unique Dual Index Kit (289–384) 96 Rxns ¥7,370
无标题文档
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)
· 保留链来源信息:转录本的链来源识别准确率>99%
· 快速,简便流程:整个文库构建流程仅需5 h
· 起始范围广:适用于人,小鼠或大鼠100 ng-1 μg总RNA
· 样本兼容性广:兼容不同品质RNA,不同重复之间均可获得可靠数据。RIN值3-10的总RNA均可获得高质量重复数据
· 适用Illumina测序平台:最多支持同时构建384 UDI测序文库
注:本试剂盒不含index,可搭配使用Unique Dual Index (UDI) kits(单独销售)
 
■ 产品说明
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)可以提供从100 ng–1 μg哺乳动物总RNA构建Illumina测序文库的解决方案。本试剂结合了RiboGone和SMART技术,可以无缝融合rRNA去除和链特异性文库构建过程。
由于rRNA约占总RNA的90%,在文库构建前高效去除这些高丰度转录本可以降低测序成本,提升数据比对率。核心SMART技术可以在RT和PCR扩增过程中添加index和测序接头,无需下游文库构建,并且可以保留链来源信息。
 
不同样品起始量解决方案
· 250 pg-10 ng总RNA,推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 10-100 ng总RNA,推荐使用SMART-Seq Total RNA Mid Input
 
■ 建库原理
A:利用RiboGone技术从总RNA样品中去除rRNA
B:利用SMART技术合成第一链cDNA
C:通过PCR扩增生成测序文库
 
■ 不同品质的样本均可获得可靠的结果
选择不同品质(RIN3和RIN7)的小鼠肝脏RNA样本,分别以100 ng和1 μg的样本量起始,使用该试剂盒制备RNA-Seq文库。结果显示,不同起始量,不同品质的样本之间的测序mapping率以及基因检测数的差距不大。而且转录本的链识别率均在95%以上。
 
■ 再现性高
(1)样本重复之间的一致性
以100 ng的HURR样本起始,两次生物学重复,制备RNA-seq文库。散点图说明,两个重复之间的FPKMs的相关性高。
 
(2)不同品质RNA样本之间的一致性
选择不同品质(RIN3和RIN7)的小鼠肝脏RNA样本,以1 μg的样本量起始,分别使用该试剂盒制备RNA-Seq文库。散点图说明,不同品质RNA样本之间的FPKMs的相关性高。
 
注:
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)是SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian的等效替代品。只有如下细微变动,本次更新并不影响这些试剂盒的流程和性能。
· 灵活的选择:试剂盒中不包含index,但也可以与Unique Dual Index (UDI) kits搭配使用。
 
 
产品详情请点击:
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页面更新:2024-01-12 10:44:59

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