可靠的单细胞/微量样本的mRNA全长分析 |
SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA |
· 高灵敏度 — 起始量:1-1000个细胞或10 pg-100 ng总RNA · 高质量的RNA-Seq数据 — 高基因检出数,支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等 · 单管操作流程 — SMART-Seq mRNA LP包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差 · 增强的测序性能 — SMART-Seq mRNA LP可搭配整合双端特殊index(UDI),构建Illumina测序文库 · 完整的流程 — 搭配特别开发的Cogent™ NGS Analysis Pipeline (CogentAP) 和Cogent NGS Discovery Software (CogentDS)完成测序数据分析。 |
■ 产品说明: |
SMART-Seq mRNA LP和SMART-Seq mRNA,这两个试剂盒是Takara经典的SMARTer Ultra low系列。它们都是使用oligo(dT)引物起始,优化用于从10 pg-100 ng的高品质total RNA(RIN≥8)或1-1000个完整细胞的全长转录组分析。 SMART-Seq mRNA是基于SMART技术(Switching Mechanism at 5' End of RNA Template)优化改良,用于微量RNA或少量细胞cDNA合成的试剂盒,提供全长转录本信息,支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等。另外,TSO中整合了LNA(locked nucleic acid)技术,提升了模板转换效率,能获得更高的再现性、更均一的gene body覆盖度,高GC含量转录本也能得到正确分析。 SMART-Seq mRNA LP在包含核心的cDNA合成试剂基础上,采用Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, 和11,072,823),利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。另外,搭配使用的双端特殊index(UDI),可以提供完整的从样品到cDNA合成到文库构建的实验体验。同时搭配特别开发的Cogent NGS生物信息学分析软件,能直接对下机数据进行分析(*科研及盈利机构在用该试剂盒建库后,均可免费使用Cogent NGS分析测序数据!) 如果对上述特点感兴趣,并正在使用完整的、高质量的单细胞,推荐使用SMART-Seq mRNA Single Cell。 如果是降解样本,选择随机引物起始,推荐使用:SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR™ Mammalian)。 |
■ 流程概要: |
注意:SMART-Seq mRNA LP和SMART-Seq mRNA是SMART-Seq v4 PLUS和SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing的等效替代品,只有如下细微变动,本次更新并不影响这些试剂盒的流程和性能。 |
· SeqAmp CB PCR buffer替代SeqAmp PCR buffer,以改善核酸纯化过程磁珠-沉淀物形成。 · 不再包含Afa I, 10X Afa I Buffer和0.1% BSA(因为在protocol中未使用) · 样本的起始范围从10 pg~10 ng扩展到10 pg~100 ng total RNA · 更灵活的选择:SMART-Seq mRNA LP试剂盒中不包含index,但也可以与Unique Dual Index (UDI) kits搭配使用 |
产品详情请点击: |
页面更新:2024-08-21 15:50:27