· 升级的SMART技术—带有LNA修饰的SMART-Seq v4 oligo 加升级的配方带来更好的性能
(灵敏度高,更好重复性,更多的GC-rich基因)
· 末端捕获流程—大部分reads集中于3’端,同时维持出色的灵敏度,缩减了差异表达分析需要
的reads数
· 高达12个样品pool—内嵌的indexes作为细胞barcode,可以实现在每个测序lane中高达12个样品
的pool,进一步缩短时间,降低成本
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单细胞转录组研究对于研究细胞群内不同单细胞表达情况非常重要。Takara Clontech 研发了单细胞mRNA转录本末端捕获技术,该技术侧重于3’端的末端捕获,使您可以用更少的测序reads获得高品质测序数据。本试剂同样采用了领先的SMART-Seq v4 技术,结合了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) 技术和LNA (Locked Nucleic Acid) 技术。
本试剂除了侧重于mRNA转录本3’端外,还包含了内嵌的indexes作为Read2的细胞barcode,可以实现在每个测序lane中高达12个样品的pool,进一步缩减了时间和研究成本。本试剂可以1–10.5 μl体系起始,依赖于Illumina Nextera® XT DNA Library Preparation Kit。本试剂设计并经验证可以用于以下测序平台的cDNA文库和测序文库制备:HiSeq®,NextSeq®,MiSeq®和MiniSeq®。 |
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图1. 末端捕获方法简介 |
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表1. K562单细胞pool文库主要测序数据 |
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图2. 从K562单细胞中检测到的基因数 |
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