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点击查收,Takara RNA建库新品指南!
 
大家好,Takara更好的Total RNA建库产品,水灵灵地来了!

SMART-Seq® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian)
 
在转录组测序领域,Takara Bio提供的SMART技术,帮助研究人员进一步突破RNA-Seq灵敏度上限,提供高质量的Total RNA分析结果。特别是针对于微量样本、困难样本,之前推出的SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2/v3- Pico Input Mammalian系列仰仗自身过硬的产品性能,在肿瘤研究、病原微生物检测、液体活检等领域的转录组分析大受好评。

本次,在SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2/v3- Pico Input Mammalian的基础上进行了升级,具体有哪些亮眼的特点,一起来看吧!
 
01速速速,解锁更高的rRNA信息去除水平
核糖体RNA在总RNA中占有很高的比重。在制备文库前从总RNA中去除核糖体来源的RNA,有利于降低测序成本,提高数据的mapping率。

BUT,在以微量样品起始时,常见的去除rRNA的前处理手段,有可能会造成纯化后的样品太少而不能制备高品质测序文库。

本试剂盒采用特异针对哺乳动物rRNA和部分线粒体RNA的探针去除核糖体cDNA(来源于核糖体RNA的cDNA片段),而无需进行核糖体前处理操作。简单方便的同时,也省去您需要单独购买rRNA去除产品的烦恼!
 
而且!本次新产品相较于前一代版本产品,性能UP UP UP,rRNA去除率提升啦!
 
 

★ Takara案例1
选择250 pg的人脑RNA样本起始,使用SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理(+)和未处理(-),然后通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。同时,使用前一代版本产品SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian对250 pg的人脑RNA样本制备文库。最后使用CogentAP 对3x106PE reads进行数据分析。如下图所示,与前一代版本产品相比,SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR Mammalian)制备的文库,rRNA相关reads百分比明显降低,外显子reads百分比增加!rRNA相关reads百分比明显降低,外显子reads百分比增加!
 

 
02 收收收,困难样本,微量样本统统拿下
与前一代版本一样,同样维持高水准,能分析质量特别、特别差的FFPE、cfRNA、外泌体以及病原微生物来源的样本(RIN3-10,DV200≥25%)。可以人、大/小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA,或者直接以10-1000个细胞样本起始,快速高效的构建链特异性文库,科研人员再不用担心珍贵样本损失了。
 

★ Takara案例2
使用本试剂盒制备10 ng FFPE RNA文库 (RIN=3, DV200=77%)。采用CogentAP对3x106 PE reads进行数据分析。如下图显示,即使以降解FFPE样本起始,也可有效去除rRNA来源cDNA,并获得可靠的测序数据结果。
 

 

★ Takara案例3
选择10 ng的人原代B细胞来源的Total RNA样本起始,使用SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的模块处理(+)和未处理(-),然后通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。最后使用CogentAP 对3x106 PE reads进行数据分析。如下图显示,对于B细胞来源的样本,同样可以获得较低的rRNA比对率,以及较高的转录本检测数!
 

 
03 顶顶顶,UMI的倾情加盟帮助获得更准确的结果
还有非常重要的一点,本试剂盒添加分子标签(UMIs):在文库制备过程中,通过逆转录步骤(在PCR扩增之前)添加8 nt UMI,因此可以灵敏地识别PCR重复片段并校正PCR扩增错误,从而进行正确的样本数据回溯,提供更可靠的RNA-Seq分析!
 
 
PS:另外还有两款同系列新品,同样值得关注!
 
三者之间具体的相同点和不同点,请参考下图。
 
所以想做微量样本Total RNA转录组分析时,选择上述SMART-Seq® Total RNA (ZapR Mammalian)系列,准没错!
 
 

页面更新:2024-12-02 10:37:34