Takara表观遗传学研究工具大赏

机构用户解决方案

产品选择指南

PCR·等温扩增

PCR Enzyme的选择 PCR原理说明高成功率PCR优选酶：TaKaRa Ex Premier 高保真酶：PrimeSTAR系列基本PCR：Taq、Ex Taq、LA Taq系列无需提取的直接PCR：MightyAmp系列菌落PCR、预混染料的PCR酶等温扩增酶特殊用途：多重PCR，防污染等高端PCR酶（Clontech） DNA PCR相关制品 RT-PCR试剂盒具备反转录活性的PCR酶：TaKaRa Tth PCR仪器
定量PCR相关制品

qPCR学习中心反转录反应（qPCR专用）反转录反应试剂(Clontech) 嵌合荧光法检测(Takara) 嵌合荧光法检测(Clontech) miRNA 嵌合荧光法检测探针检测 Cycleave探针检测 qPCR－仪器 qPCR Primer qPCR－RNA/DNA的制备
RNA合成·体外转录

RNA合成相关单品酶 RNA修饰单品酶 RNA合成模板制备 RNA合成试剂盒及解决方案什么是mRNA生产用酶的质量等级？用于mRNA生产的酶（HQ级）
cDNA合成 & 克隆

克隆学习中心 DNA Ligation TA克隆和平滑末端克隆 In-Fusion无缝克隆 cDNA合成&文库构建 SMART全长cDNA合成&文库构建 Random Mutagenesis Site-Directed Mutagenesis 基因组DNA序列调取试剂盒 Vector（克隆用）感受态细胞修饰酶/Ligases 修饰酶/磷酸酶、激酶修饰酶/DNA & RNA Polymerase 修饰酶/焦磷酸酶修饰酶/RTase、RNase Inhibitor 修饰酶/核酸酶、拓扑异构酶 Nucleotide Buffer（Powder）etc. 什么是mRNA生产用酶的质量等级？用于mRNA生产的酶（HQ级） Others（基因工程相关制品）
NGS相关制品

NGS 学习中心单细胞 RNA-Seq 单细胞 DNA-Seq RNA-Seq DNA-Seq 生殖健康表观遗传学分析免疫库分析单细胞分选系统 NGS关联制品 PCR酶（NGS用）
自动化系统

自动化学习中心单细胞分选系统Shasta及其应用单细胞分选系统ICELL8 cx及其应用高通量Real-Time PCR系统高通量单细胞分选系统ICELL8应用
核酸提取、纯化及DNA标记

DNA片段、质粒DNA纯化基因组DNA纯化试剂(柱式法) 基因组DNA纯化试剂(试剂型) RNA提取、纯化试剂(柱式法) RNA提取、纯化试剂(试剂型) RNA保存试剂 Small RNA提取试剂病毒核酸纯化试剂盒酵母核酸纯化试剂盒核酸提取及纯化制品-Others DNA标记标记DNA-蛋白质的回收
限制酶

限制酶基本信息常规限制酶系列产品 QuickCut限制酶 RNA限制酶
电泳相关制品

核酸染料 DNA Markers RNA Markers 蛋白质Markers Agarose Loading Buffer 常用缓冲液方便装电泳相关装置
蛋白质互作研究（酵母杂交系统）

Takara酵母杂交学习中心 Matchmaker^® Gold酵母双杂系统 Matchmaker^® Gold酵母单杂系统互作的确认和评价 Matchmaker相关制品
表达调节及蛋白质性能分析

iDimerize^™蛋白质互作诱导系统 ProteoTuner^™蛋白质调节系统 Tet诱导表达系统
蛋白质表达相关制品

E.coli蛋白质表达 Brevibacillus/Bacillus蛋白质表达哺乳动物细胞蛋白质表达昆虫细胞蛋白质合成(Clontech) 无细胞蛋白质合成系统 Protein Refolding
蛋白质纯化、分析和检测

Capturem新型膜技术应用蛋白质样品制备 His标签融合蛋白质纯化 GST标签融合蛋白质纯化生物素标签融合蛋白质纯化 DYKDDDDK标签融合蛋白质纯化 Myc标签融合蛋白质纯化抗体纯化蛋白质IP&Co-IP 糖/磷酸化蛋白质纯化蛋白质检测蛋白质电泳胶染色蛋白质定量蛋白酶（His标签去除）蛋白酶（氨基酸序列分析）
基因导入（Virus、Vectors）

病毒基因传递系统选择向导重组慢病毒(Lentivirus)制品重组逆转录病毒(Retrovirus)制品重组腺相关病毒(AAV)制品重组腺病毒(Adenovirus)制品哺乳动物细胞用载体酵母、丝状真菌用载体植物用载体
转染试剂

Xfect转染试剂选择向导质粒转染试剂 RNA转染试剂 Protein转染试剂
干细胞研究相关制品

干细胞学习中心干细胞基因操作 (Cell reprogramming) 细胞 (Cell) 细胞培养产品 (Cell culture) 抗体 (Antibodies) 分化试剂盒和多能性监测 (Pluripotency and Differentiation )
表观遗传学相关制品

甲基化DNA富集相关制品 PCR/qPCR相关制品 Control Genome DNA 甲基化DNA相关酶制品亚硫酸氢盐处理相关制品
基因组编辑相关制品

CRISPR/Cas9 Cre重组酶基因敲入用长单链DNA制备
荧光蛋白质 & 报告系统

荧光蛋白质按颜色、名称分类荧光蛋白质按用途分类荧光蛋白质相关制品报告系统
抗体 & ELISA & 细胞信号转导

细胞增殖、细胞毒性测定细胞凋亡（Takara）细胞凋亡（Clontech） EIA试剂盒（Takara）免疫染色关联制品细胞信号转导（Clontech）酶活性测定试剂盒脂肪细胞、骨细胞分化试剂抗体（Takara）
细胞 & 培养相关制品

细胞培养相关制品细胞生物学检测试剂细胞解冻仪器
microRNA & RNAi研究相关制品

提取及纯化制品 microRNA定量PCR miRNA表达 Small RNA克隆 shRNA表达检测合成siRNA定量 RNAi相关制品
Library & cDNA & RNA

Human cDNA libraries series Mouse cDNA libraries series Rat cDNA libraries series cDNA、Genome DNA Total RNA & Poly A⁺ RNA
糖工学相关制品

糖工学酶糖工学试剂盒 Glycosphingolipid解析试剂
应用检测（食品-环境-人）

活菌DNA检测相关制品防污染相关制品食物中毒检测（PCR）食物中毒检测 (Real Time PCR) 食物中毒检测 (按Target选择) 肉种鉴定相关制品水质检测人感染症检测菌种鉴定支原体检测
仪器相关制品

PCR仪器支持中心 Q-PCR仪 E-PCR仪电泳仪器产品
Clontech相关组分信息表

Clontech相关组分信息表

技术服务信息

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Takara表观遗传学研究工具大赏

表观遗传学（epigenetics）是指在基因的DNA序列没有发生改变的情况下，基因功能发生了可遗传的变化，并最终导致了表型的变化。
表观遗传机制包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质结构和可触及性等等。

针对基因组高通量的表观遗传学研究，Takara提供丰富的NGS测序解决方案可供选择。
表观遗传测序解决方案 - Takara (takarabiomed.com.cn)

针对特定区域进行表观遗传学研究，Takara为您准备了各种高效的研究工具。

一.甲基化DNA富集

EpiXplore^™ Methylated DNA Enrichment Kit (Code No. 631962)

■ 原理

使用甲基CpG结合结构域蛋白2（methyl-CpG binding domain protein 2 ）（MBD2）浓缩甲基化DNA

■ 特点

·MBD2对甲基化DNA的高度特异性结合
·再现性非常高
·使用磁珠的简单操作流程
·对低、中和高甲基化DNA进行梯度分离

■ 流程

■ 应用实例

实验设计
·根据protocol富集三种样本中的control DNA，详见表中Tube1、 Tube2、Tube3，DNA已用荧光进行了标记
·比较每个样本的flowthrough（流穿液）、wash（洗涤液）和elution（洗脱液）的荧光信号值，来确定甲基化DNA富集效率。

结果说明
·高特异性地富集了甲基化DNA。
·甲基化DNA在缺乏MBD2蛋白的情况下不结合（Tube1）。
·甲基化DNA通过MBD2蛋白与磁珠结合（Tube2，IV-V）。
·非甲基化DNA不结合（Tube3）。

二.甲基化依赖型/敏感型限制酶

甲基化依赖性限制酶McrBC (Code No.1234A)

·特异地切割嘌呤核苷酸（A或G）前面的甲基胞嘧啶DNA。
·特异性地识别和切割包含两个(G/A)mC间距在40 bp-2000 bp的DNA序列。
·作用于含有甲基胞嘧啶DNA，不作用于非甲基化DNA。
·McrBC 作用于一对 PumCG 序列元件,以此检测高比例甲基化的 CpG。

甲基化敏感型限制酶

·利用某些限制酶的甲基化敏感性，切割非甲基化、甲基化或半甲基化位点

·常见的甲基化研究同裂酶Hap II/Msp I。

·登录Takara中文官网，查询更多可用于甲基化分析的限制酶
可用于DNA甲基化分析的CpG甲基化敏感型限制性内切酶 - Takara (takarabiomed.com.cn)

三.PCR扩增亚硫酸氢盐处理的DNA

TaKaRa EpiTaq HS (for bisulfite-treated DNA) (Code No. R110)

引物通常设计在CpG岛两侧的非甲基化区域，由于GC/AT-rich的核苷酸序列偏好和亚硫酸氢盐处理的DNA中存在尿嘧啶导致PCR效率降低。
通过优化DNA聚合酶和缓冲体系，本品是解决这类PCR困难点的理想选择。

■ 应用例

·亚硫酸氢盐处理的DNA甲基化分析的主要障碍是扩增更长的靶标，如BRCA1 (1,017 bp) 。
·其他聚合酶可以扩增短的靶标，但通常在长靶标时失败。
·上图显示EpiTaq HS DNA聚合酶在扩增短 (～150 bp) 和长 (～1,000 bp) 靶标方面同样有效，具有较高的成功率。

四.对亚硫酸氢盐处理的DNA进行MSP分析

EpiScope^® MSP Kit (Code No. R100)

■ MSP原理

·通过硫化处理，CpG 序列根据甲基化与否将有所改变
·通过设计甲基化DNA检出 Primer（M Primer）与非甲基化DNA检出 Primer（UM Primer）,进行 PCR 扩增。通过终点法PCR的电泳结果或qPCR结果判断gDNA的甲基化情况。

■ 产品优势

·高特异性：通过分析单个CpG位点，以高灵敏度和高准确度对甲基化/非甲基化DNA进行鉴别。
·通用性：使用相同的PCR条件，可通过终点法PCR或qPCR (TB Green)检测。

■ 应用实例

对CDH1、CDKN2A、MLH1基因的启动子区域进行MSP分析

模板

·阳性对照 EpiScope^® Methylated HeLa gDNA (Code No. 3520)
·Native HeLa genome DNA （30 ng/25 μl）

结果

Real Time PCR 与普通 PCR（电泳确认）得到同样的结果。HeLa 基因组中，CpG区域的 CDH1 出现甲基化，而 CDKN2A 和 MLH1 未出现甲基化

五.核小体定位分析析

核小体定位研究基本原理

真核生物细胞的细胞核中存在的核小体 (nucleosome) 是染色质的基本构成单位，它是由组蛋白为核心和缠绕于组蛋白的基因组DNA共同组成的。
基因组DNA上的核小体DNA以一定的间隔存在，它的存在位置与染色质构造及转录调控机制有着密切关系。
具有转录活性的基因其启动子区域中不存在核小体，一直处于转录起始时可与必要的转录因子结合的状态。
一旦该区域的DNA发生甲基化，此部位就会形成核小体，转录因子不能与启动子区域结合使转录受到抑制。

核小体制备试剂盒EpiScope^® Nucleosome Preparation Kit (Code No. 5333)

■ 应用实例

结果
·SW48细胞中，A-F每个区域，gDNA与核小体DNA量接近，即gDNA绝大部分与组蛋白结合成为核小体，抑制表达，SW48细胞中MLH1的表达量远低于Hela细胞，与核小体数量呈相关性。
·这些结果表明，在SW48细胞中，核小体密集于MLH1基因上游区域 (异染色质)，而在HeLa细胞中，核小体分散存在于该区域 (常染色质) 。

■ Takara表观遗传学相关产品列表

	简介	Product	Code No.
甲基化DNA研究	甲基化DNA富集	EpiXplore^™ Methylated　DNA Enrichment Kit	631962
	甲基化依赖型/敏感型限制酶，COBRA用	McrBC	1234A
	甲基化依赖型/敏感型限制酶，COBRA用	可用于DNA甲基化分析的CpG甲基化敏感型限制性内切酶
	亚硫酸氢盐处理 DNA 的PCR专用引物设计软件	MethPrimer
	亚硫酸氢盐处理 DNA 的PCR专用引物设计软件	BiSearch
	亚硫酸氢盐处理的DNA模板PCR	TaKaRa EpiTaq^™ HS	R110
	Methylation Specific PCR (MSP)	EpiScope^® MSP Kit	R100
	甲基化gDNA，阳性对照用	EpiScope^® Methylated HeLa gDNA	3520
	甲基化gDNA，阳性对照用	EpiScope^® Methylated HCT116 gDNA	3522
	非甲基化gDNA，阴性对照用	EpiScope^® Unmethylated HCT116 DKO gDNA	3521
	甲基化DNA+NGS	EpiXplore Meth-Seq DNA Enrichment Kit	635023
染色质 & 核小体研究	动物培养细胞中制备核小体	EpiScope^® Nucleosome Preparation Kit	5333
	微球菌核酸酶，ChIP或核小体制备用	Micrococcal Nuclease	2910
	蛋白酶K，ChIP或核小体制备用	Proteinase K	9034
	RNA酶A，ChIP或核小体制备用	RNase A	2158
	ChIP+NGS	DNA SMART ChIP-Seq Kit	634865+634887

页面更新：2024-06-28 15:39:23