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96孔板做克隆?!我那惊人的实验搭子
 
In Fusion Snap Assembly,无缝克隆的理想之选,在低背景下,简单的操作,即可进行无需酶切连接、准确率达到95%的高效克隆。In-Fusion克隆系统的简单性和准确性,使其非常适合高通量克隆工作流程。
 
自动化移液系统(Liquid handling systems)减少了人工操作中产生的错误和操作时间,并提高了产量及可重复性。分子克隆是得益于这类平台的基因工程技术之一,这类平台被广泛应用于高通量基因组装,如抗体发现、蛋白质组学和寡核苷酸/基因合成等研究领域。
对于高通量平台来说,基于PCR的无缝克隆由于其简便性、准确性和灵活性,优于其他传统的克隆方法(如酶切连接克隆或TA克隆)。然而,克隆试剂与特定移液系统的兼容性常常被忽视,而且实验流程并非总是适配的。
目前我们已和Beckman以及Eppendorf进行联用,通过在Beckman以及Eppendorf 平台上实现Takara Bio生物学研究试剂的自动化,研究人员将受益于简化的工作流程、短暂的手动操作时间和更高的可重复性,从而提高实验的准确性和效率。
 
让我们一起来看看具体的实验例吧!
 
实验例1
♦ 平台
Beckman Coulter Life Sciences Biomek i7 Dual Hybrid Workstation
♦ 试剂
Takara Bio In-Fusion Snap Assembly Master Mix
♦ 应用
Beckman使用96孔板进行自动化克隆反应
♦ 目的
将DNA 线性化片段 (3.7 kb)插入到Hind III酶切的pUC19线性化载体中 (2.7 kb)。
♦ 方法
目的序列通过PCR扩增,分别使用与线性化载体的5'和3'端同源的正向和反向引物。PCR产物纯化后,使用Biomek i7 Dual Hybrid工作站将In-Fusion Snap Assembly反应液分配到96孔板中。孵育后,克隆反应液被转化到感受态细胞中,并涂布在选择培养基上,以便进一步分析(图1)。
图1 Biomek i7 Dual Hybrid工作站上的自动In-Fusion克隆工作流程示意图
♦ 结果
Biomek i7 Dual Hybrid分注准确,通过测试5μL和10μL两种反应体积来验证In-Fusion克隆反应的菌落数量和克隆准确性。结果表明菌落数分别能达到700、800以上,且准确性能达到90%以上(图2)。
图2 In-Fusion克隆反应的菌落数量和克隆准确性
 
实验例2
♦ 平台
Eppendorf epMotion® 5075t
♦ 试剂
Takara Bio In-Fusion Snap Assembly Master Mix
♦ 应用
Eppendorf使用 96 孔和384孔板进行自动化克隆反应
♦ 目的
将DNA 线性化片段 (3.7 kb)插入到Hind III酶切的pUC19线性化载体中 (2.7 kb)。
♦ 方法
使用epMotion® 5075t将In-Fusion Snap Assembly反应液分配到96或384孔板中。孵育后,克隆反应液被转化到感受态细胞中,并涂布在选择培养基上,以便进一步分析(图3)。
图3 epMotion® 5075t工作站上的自动In-Fusion克隆工作流程示意图
♦ 结果
Eppendorf分别对96孔和384孔板进行实验,epMotion可以同时处理5μL和 10μL的In-Fusion Snap Assembly的克隆程序,并成功分离移液和预混液。共得到40个阳性样本测序结果,该结果显示了>95%的克隆准确率,表明利用epMotion进行自动化液体处理,可以成功地进行In-Fusion无缝克隆,而且不会影响该克隆技术的高准确度。未克隆成功的菌落很少,且控制在非线性化载体的正常背景水平内(表1,图4)。
表1 不同移液方法和回收体积的菌落计数
 
图4 使用 epMotion 进行In-Fusion克隆反应设置。两种移液方法,分离式(标记为“Separate”)和预混合(标记为“Premix”)移液,使用 epMotion 建立 In-Fusion 反应。图形值是独立的克隆反应。误差线显示±标准偏差。准确性由Sanger测序确定。
♦ 结论
上述两个实验案例证明了In-Fusion无缝克隆可以与Biomek i7 Dual Hybrid工作站和Eppendorf epMotion 系统轻松适配,且不影响我们对这项技术所期望的高准确度和高效率。
 
具体优势如下:
· 可以让研究者提高克隆成功率
· 可以通过缩小克隆反应体积,来降低克隆试剂的前期成本
 
新的一年,In Fusion Snap Assembly(Code No. 638947/48/49)将以全新的价格,更高性价比面向大家,欢迎各位老师前来选购!
订购方式:
1.可联系当地代理商
2. 登录Takara官网进行订购
 
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页面更新:2024-02-19 11:36:38