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Takara qPCR引物/探针设计工具数据库升级啦!

 

Takara qPCR引物/探针设计工具于2023年11月1日在Takara中国官网发布,供购买Takara qPCR重点产品的您免费设计引物/探针,欢迎使用。
 
该系统设计的引物具有以下特点:
1. 序列经过特别设计,引物二聚体形成率低。
2. 跨内含子设计,减少基因组DNA的扩增。
3. 引物中不包括已知的SNP(对于人类基因,引物中不包括置信度较高的SNP)。
4. 通过同源检索确认了特异性。
5. 可以根据实验目的选择设计区域,例如在全域设计或在3'侧设计。
 
  Takara qPCR引物/探针设计工具数据库升级
 
① Perfect Real Time支持系统for probe法已升级!(2024年1月25日)
我们根据2023年11月的目标物种(人、小鼠、大鼠)的基因序列信息为基础设计,并更新了数据库。
版本升级前后的设计基因数和设计转录本数如下。
 物种  assembly  设计基因数  设计转录本数
 升级  升级
 前  后  前  后
 人  hg38  23,592  24,866  61,603  67,899
 小鼠  mm39  23,434  23,789  42,050  49,842
 大鼠  rn7  17,349  17,852  19,374  20,460
 
② Perfect Real Time支持系统for染料法已升级!(2024年1月25日)
我们根据2023年11月的目标物种(人、小鼠、大鼠、牛、狗、鸡)的基因序列信息为基础设计,并更新了数据库。
这次没有进行拟南芥、水稻的版本升级。
版本升级前后的设计基因数和设计转录本数如下。
 物种  assembly  设计基因数  设计转录本数
 升级  升级
 前  后  前  后
 人  hg38  23,894  25,215  62,111  68,495
 小鼠  mm39  23,629  23,993  42,277  50,125
 大鼠  rn7  17,417  17,922  19,448  20,536
 牛  bosTau9  20,438  20,973  62,637  63,683
 狗  canFam6  20,747  21,296  125,579  185,289
 鸡  galGal6  17,949  17,968  124,823  124,793
 
注:
版本升级前:基于2022年5月的序列信息设计
版本升级后:基于2023年11月的序列信息设计

请充分利用这个设计工具。
 
 
  引物探针设计流程如下
 
* 填写正确的qPCR试剂信息,可以免费设计一次;每个qPCR试剂信息仅限使用一次。
 
  qPCR引物探针设计工具简介
Takara qPCR引物探针设计工具是基于Takara Bio总部的Perfect Real Time Support System (PRTSS);
★ Perfect Real Time Support System (PRTSS) 用于实时荧光定量PCR的引物/探针设计。
★ 使用Takara特别的引物设计技术,结合不断更新的NCBI遗传信息数据库,搭配生物信息学优化的引物设计,帮助研究人员完成复杂的引物设计工作。
★ PRTSS设计的引物和探针,针对Takara的qPCR试剂和缓冲体系进行了优化,与Takara试剂配合使用,可以获得更好的qPCR结果。
★ 凡是订购Takara qPCR相关重点产品(具体Code No.详见下表),即可免费使用PRTSS进行引物/探针设计。
注:使用Takara qPCR引物探针设计工具时,需要SEQ信息,SEQ信息通过扫描产品外包装获得,请保留以下列表中产品外包装。
Code No. 制品名称 可以使用的Lot
RR430A TB Green® Fast qPCR Mix 2024年3月到期以后的Lot
RR390L Premix Ex Taq™ (Probe qPCR), Bulk
RR82LR TB Green® Premix Ex Taq II (Tli RNaseH Plus), ROX plus
RR036A PrimeScript™ RT Master Mix (Perfect Real Time) 2024年4月到期以后的Lot
RR037A PrimeScript™ RT reagent Kit (Perfect Real Time)
RR42LR TB Green® Premix Ex Taq (Tli RNaseH Plus), ROX plus
RR047A PrimeScript™ RT reagent Kit with gDNA Eraser (Perfect Real Time) 2024年9月到期以后的Lot
RR820A TB Green® Premix Ex Taq™ II (Tli RNaseH Plus)
RR420A TB Green® Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus)
RR820L TB Green® Premix Ex Taq™ II (Tli RNaseH Plus), Bulk
RR420L TB Green® Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus), Bulk
RR391A Probe qPCR Mix 2025年1月到期以后的Lot
RR390A Premix Ex Taq™ (Probe qPCR)
CN830A TB Green® Premix Ex Taq™ II FAST qPCR
RR092A PrimeScript™ FAST RT reagent Kit with gDNA Eraser
RR393A Probe qPCR Mix MultiPlus 全部可用
 
 

页面更新:2024-02-05 09:22:51