背靠《Nature》,揭秘SMART-Seq技术助攻:肿瘤细胞如何策反Treg细胞 |
提到肿瘤细胞和免疫细胞,一般我们想象的画面是:英勇的T细胞像一个个战士,在人体内与肿瘤细胞斗智斗勇,以杀死肿瘤细胞保卫身体为终极目标。 所以按理说,肿瘤细胞和免疫细胞应该永远是仇人般刀兵相见,势不两立。但是也正如武侠世界里总有那么几个经不住诱惑而转身叛变的人。有这么一类免疫细胞,在狡猾的肿瘤细胞的糖衣炮弹攻击下被成功策反,反过来帮助肿瘤细胞逃避免疫系统的“追杀”。 |
2021年2月15日,美国匹兹堡大学的Greg M. Delgoffe教授团队在Nature上发表题为:Metabolic support of tumor-infiltrating regulatory T cells by lactic acid 的文章,证实肿瘤细胞不仅能通过剥夺效应T细胞的营养逃避“追杀”,还为“友军”调节性T细胞(Treg细胞)提供乳酸来对抗效应T细胞的杀伤作用。 |
文献概要 |
研究表明,Treg细胞虽然对维持免疫稳态至关重要,但因为肿瘤微环境(tumour microenvironment, TME)能够促进Treg细胞聚集、分化和激活,所以Treg细胞也是癌症免疫的主要障碍。肿瘤细胞代谢紊乱促使一个代谢物耗竭、缺氧和酸性的TME形成,因此浸润的效应T细胞要与肿瘤细胞竞争代谢产物,并受到TME中Treg细胞的强烈抑制作用。之前的研究结果表明Treg细胞与效应T细胞的代谢方式不同,所以作者猜想TME的代谢变化与Treg细胞活性增强相关。 研究发现,Treg细胞代谢灵活,通常被认为是糖酵解代谢副产物的乳酸,可以作为Treg细胞维持其高抑制能力的来源。阻止TME中Treg细胞摄取乳酸会减缓肿瘤生长并增加对免疫治疗的反应。 总的来说,Treg细胞能够在TME中使用“替代”代谢物来维持其免疫抑制特性。此外,研究结果表明,肿瘤细胞通过剥夺效应T细胞的营养,并通过代谢支持Treg细胞群来避免被“破坏”。 |
涉及的Takara产品 |
在该项研究中,使用Takara产品SMART-Seq HT Kit(Code No. 634456)分别对纯化的低糖亲和力(2NBDGlow)和高糖亲和力(2NBDGhigh)的Treg细胞亚群进行转录组分析,以进一步了解不同葡萄糖亲和力下Treg细胞的基因表达情况。 |
SMART-Seq HT Kit产品信息 |
★ 流程更加简便,让您在科研路上更快一步! |
SMART-Seq HT Kit是在经典的SMART技术的基础上进行了优化改良。搭载one-step RT-PCR技术,4小时内即可制备高品质的全长cDNA! 而且它兼容自动化移液工作站,采用oligo(dT)引物,支持1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA起始,可以更少的时间分析更多的样本! |
★ 保留全长基因信息,性能依然卓越! |
SMART-Seq HT Kit保持了SMART技术一贯的高水准的单细胞cDNA合成性能,不仅提供全长转录本的信息,还支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等内容。同时,价格更加亲民,具有比较高的性价比! |
使用SMART-Seq v4试剂盒和SMART-Seq HT试剂盒从21个293T单细胞制备文库,然后进行测序分析。从上图可以看出,SMART-Seq v4试剂盒和SMART-Seq HT试剂盒在基因表达分析中没有显著的偏差! |
新品推荐:SMART-Seq HT PLUS Kit(Code No. R400748) |
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位,我们全新推出了SMART-Seq HT PLUS Kit。在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823)及单次使用的双端特殊index(UDI),提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验! |
★ 从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发,构建更高品质Illumina文库 |
数据来源于Takara Bio USA, Inc. |
Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq HT Kit完成cDNA合成。随后分别使用SS-HT Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。测试数据中可以看出,SS-HT PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍。并且SS-HT PLUS文库能比A公司文库多检出10%的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息! |
页面更新:2022-03-18 15:45:35