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添加分子标签的RNA-Seq分析试剂盒上市啦!
 
有时候,标签是个贬义词,害怕被贴标签,害怕被定义,被束缚。
但有时候,标签又是个褒义词。比如在构建测序文库时,通过添加特别的“分子标签”(Unique Molecular Identifiers, UMIs),可以更好的校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取。
 
(您也可以抽大约五分钟时间,读一读我们之前推送UDI?UMI?快来围观宝藏主播找答案吧的文章,相信可以帮您详尽地了解UMI和UDI。)
 
目前,各路科研工作人员面临的NGS检测灵敏度与特异性的瓶颈,可能是由样品准备、扩增偏差及测序错误所引起的。而向Ilumina文库添加特有的分子标签UMI能有效改善这一问题。出于文库制备与测序质量直接相关的考虑,Takara特别优化推出了接头上带UMIs及整合UDIs的全新产品SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
 
它的前一代产品SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian仰仗自身过硬的产品性能,在肿瘤研究、病原微生物检测、液体活检等领域的转录组分析大受好评。
 
那么,SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian有何过人之处?
 
来自UMIs的“鼎力相助”
非常重要的一点,添加分子标签(UMIs):在文库制备过程中,通过逆转录步骤(在PCR扩增之前)添加8nt UMI,可以灵敏地识别PCR重复片段并校正PCR扩增错误,从而进行正确的样本数据回溯,提供更可靠的RNA-Seq分析!
 
UDIs技术的“加持”
该试剂盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit - 24U (Code No. 634451),能更正确拆析采用图案化流动槽技术(Patterned flow cell)测序平台(如NovaSeq system)的下机数据,同时也支持更多样本同时测序。
 
直击痛点,无需担心RNA质量差
与前一代一样,它同样无惧RNA降解,能分析质量较差的FFPE、cfRNA、外泌体以及病原微生物来源的样本。并且无需核糖体RNA前处理,更小的手动操作误差,可直接以人、大/小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或者10-1000个细胞样本起始,快速高效的构建链特异性文库,科研人员再不用担心珍贵样本损失了!
 
Takara案例分析
从FFPE样本中分离纯化核酸进行NGS分析研究逐渐成为重要手段,但由于FFPE样本容易发生核酸的降解和损伤,所以从有限且珍贵的FFPE样本中获得完整且正确的信息进行建库测序非常具有挑战性!但有了Takara FFPE样本分析利器,事情正在发生变化!
 
Takara科学家采用以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE组织提取的总RNA起始,采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian制备RNA-Seq文库(均做两个重复),并使用NextSeq 500进行测序。
 
结果显示,同一样品不同起始量的情况下,测序数据非常相似,并且技术重复之间具有高度一致性。而TPM≥1的基因检测数也均超过18,000。特别值得注意的是,比对到核糖体rRNA和线粒体基因组的比率相对较低。
 
所以对有限且珍贵的样本的测序分析具有较大难度时,选它--SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian,没错!
 
产品列表
从FFPE样本中分离纯化核酸进行NGS分析研究逐渐成为重要手段,但由于FFPE样本容易发生核酸的降解和损伤,所以从有限且珍贵的FFPE样本中获得完整且正确的信息进行建库测序非常具有挑战性!但有了Takara FFPE样本分析利器,事情正在发生变化!
 
Code No. 产品名称 包装量
634485   SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian 24 Rxns
634486   SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian 48 Rxns
634487   SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian 96 Rxns
634488   SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian 192 Rxns
 
 
 
 
 

页面更新:2020-12-02 14:18:55