Premix Ex Taq (Probe qPCR)

 
应用LightCycler/LightCycler 480 System的操作方法
请按照LightCycler/LightCycler 480(Roche Diagnostics公司)的使用说明书要求进行实验操作
 
1. 按下列组份配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行)。
试剂 使用量 终浓度
 Premix Ex Taq(Probe qPCR)(2X) 10.0 μl   1X  
 PCR Forward Primer(10 μM) 0.4 μl   0.2 μM*1  
 PCR Reverse Primer(10 μM) 0.4 μl   0.2 μM*1  
 Probe 0.8 μl   *2  
 DNA模板 2.0 μl   *3  
 dH2O(灭菌水) 6.4 μl    
 Total 20.0 μl    
*1 通常引物终浓度为0.2 μM可以得到较好结果。反应性能较差时,可以在0.1-1.0 μM范围内调整引物浓度。
*2 使用的探针浓度,与使用的Real Time PCR扩增仪、探针种类、荧光标记物质种类有关,实际使用时请参照仪器说明书,或各荧光探针的具体使用要求进行。
*3 模板添加量因模板溶液中存在的靶基因的拷贝数不同而不同,进行梯度稀释研讨适当的模板添加量。模板DNA添加量最好在100 ng以下。以RT-PCR反应的cDNA (RT反应液) 为模板时,添加量不要超过PCR反应液总体积的10%。
 
2. 进行Real Time PCR反应。
PCR反应用毛细管请用离心机轻轻离心后放入LightCycler中进行Real Time PCR反应。建议采用下列图表显示的两步法PCR反应程序,如果该程序得不到良好的实验结果时,再进行PCR条件的优化。有关PCR的具体反应条件请参照「PCR反应条件概述」。
<LightCycler>
两步法PCR扩增标准程序:
Stage 1:预变性
95℃ 30秒 20℃/秒
1 Cycle
Stage 2:PCR反应
95℃ 5秒 20℃/秒
60℃ 20秒 20℃/秒
40 Cycles
 
 
 
<LightCycler 480 System>
两步法PCR扩增标准程序:
  Denature
95℃ 30秒 (Ramp rate: 4.4℃/sec)
1 Cycle
  PCR
Analysis Mode: Quantification
95℃ 5秒 (Ramp rate: 4.4℃/sec)
60℃ 30秒 (Ramp rate: 2.2℃/sec, Acquisition Mode : Single)
Cooling Cycle
  Cooling
50℃ 30秒 (Ramp rate: 2.2℃/sec)
1 Cycle
 
 
◆特别提示:
本制品中使用的TaKaRa Ex Taq HS是利用抗Taq抗体的Hot Start用DNA聚合酶,与其他公司的化学修饰型Hot Start用DNA聚合酶相比,不需要PCR反应前的95℃、5-15分钟的酶的活性化反应。如果高温处理时间过长,会使酶的活性下降,其PCR的扩增效率、定量准确度等都会受到影响。如果在PCR反应前进行模板的预变性,通常设定为95℃、30秒。
 
3. 实验结果分析。
反应结束后确认Real Time PCR的扩增曲线,进行PCR定量时制作标准曲线等。分析方法参见仪器的操作手册。